3、进化基因组学 导师：王文研究员   
在这个基因组学时代，理解浩如烟海的基因组学数据不仅是一个热门的话题，更是一件具有挑战性的科学课题。本实验室侧重于了解在进化历程中基因组新结构和新功能产生的机制和过程。近期的工作主要是与芝加哥大学生态与进化学系的龙漫远教授实验室一道，研究新基因产生的过程和机制。我们目前在这方面的研究处于领先地位。各种生物中的基因数目有巨大差异，研究基因如何产生不仅是进化生物学中的重大课题，也是生命科学中的根本性问题。了解自然界如何造基因对于人类设计和筛选生物活性药物也将有指导意义.
本实验室是中国科学院和德国国家科学院--Max-Planck协会资助的实验室，已与和将与一些世界知名的大学和实验室建立合作。我们欢迎有志于进化基因组学的优秀学生加入我们的研究生计划。我们有富有前景的研究计划和课题，我们将提供最好的学术和实验条件，包括必要时到国外好的实验室学习和进修，以使每一位研究生有机会作出一流的研究工作，为他（她）们将来成为独立的优秀科学家奠定坚实的基础。因此，我们将坚持宁缺勿滥的原则，希望每一位想报考的同学较早时候即与本人联系，经过讨论发现双方有共同兴趣后再报名，以免浪费您的时间和机会。
4 、蛋白质结构与功能的进化 导师：黄京飞副研究员   
利用国际上的各类生物大分子数据库中序列、结构和功能信息及一系列先进的计算机软件，在比较蛋白质家族和超家族三维结构的基础上，开展蛋白质序列、拓扑结构、功能与其进化关系的研究，探讨蛋白质的不同进化模式对其序列－结构－功能关系的影响、蛋白质超家族形成的基因进化模式。从进化的角度，研究蛋白质结构与功能的序列识别这一结构基因组学中的重要问题。

071009细胞生物学
1 、分子细胞生物学 导师：文建凡研究员   
主要在分子和细胞两个层次上研究真核细胞的结构、功能机制和基因、基因组以及它们在不同进化地位生物中的多样性和进化形成的机制。开展细胞生物学、生物化学、分子生物学、原生生物学、微生物学和进化生物学等多学科的交叉研究。目的在于从系统发育和进化的视角考察和阐明现存的真核细胞（尤其是高等真核细胞）为什么具有如此这般的精细结构和精妙的功能活动机制，它们是怎样进化发展和不断完善的，其进化的动力和机制规律是什么，以及真核细胞的进化是如何为后续的生物多样性和复杂性的大发展奠定基础的。以期达到对真核细胞本身乃至由其所构建的真核生物的认识从“知其然”到“知其所以然”的深化。目前本实验室采用细胞、生化、分子生物学和生物信息学等技术方法，主要以一系列处在关键进化地位的单细胞生物为主要研究对象，结合其它不同进化地位生物的相关研究结果，集中探讨真核细胞的重要结构（如核骨架、核纤层、核仁和线粒体等细胞器）、功能活动机制（如核分裂、细胞内蛋白分选和定位系统、糖酵解和磷脂合成等代谢途径）和相关的重要基因、亚基因组（如核仁功能亚基因组）在生物界不同进化地位生物中的多样性及其演化规律。基于上述基础研究的积累，近年来还开展有害生物（如“水华”蓝藻、恶性寄生虫等）的特异性防治靶标的研究。本研究方向为中国科学院昆明动物研究所“细胞与分子进化重点实验室”的研究方向之一，其研究视角和学术思想很具特色。
2、早期胚胎发育的基因调控 导师：毛炳宇研究员   
本课题组将侧重研究脊椎动物早期神经诱导与图式形成中的基因调控网络。中枢神经系统的分化是脊椎动物胚胎发育过程中的重要事件，BMP, Wnt, FGF, Hedgehog 等信号分子在这一过程中起着关键调控作用。这些信号分子共同调节其下游靶基因在神经板的特定区域表达，决定神经管前后轴和背腹轴的分化，进而决定不同神经细胞类群在神经系统中的分布，从而形成一个有功能的中枢神经系统。但在分子水平这些不同信号途径是如何协同作用，最终精确调控其靶基因表达, 其机制仍不清楚。本课题组将以非洲爪蟾为实验动物模型，采用分子生物学技术，显微注射，原位杂交技术等手段，筛选早期胚胎神经系统特异表达的新基因并研究其功能; 另一方面将结合生物信息学手段和转基因技术等，系统分析3-4个神经特异表达基因的顺试调控序列，分析其整合来自于不同信号途径的转录调控信息的机制。
3、分子免疫生物学    导师：张华堂研究员 
　
　　本学科组成员的研究经历和兴趣，涉及免疫生物学机制在病毒感染（包括 HIV/AIDS 的发病、抗病、防病）和肿瘤的发生、发展、转移和防治中的作用。而机体与外来的病毒和与内在的癌变细胞都不是一成不变的、单向的免疫识别和免疫清除。病原（病毒）和病变（肿瘤）与宿主之间呈现双向互动的免疫生物学关系。这种动态的影响与变应，双向的选择和适应，最近已被形象地描述为免疫剪辑过程（ immunoediting ），决定着相关疾病的发生、发展和结局。
　
　　因此，采用现代免疫学和生物学的双向视角，运用现代免疫学和生物学的双向思维方式，融汇免疫学和生物学的原理和技术，是试图理解和回答病毒感染和肿瘤生长过程中诸多问题的基本要求和必然选择，也是近年来在国际上已证明为富有突破性成果的研究思路和领域。
　
　　基于上述思考和当今免疫生物学研究的最新进展，本学科组将以病毒和肿瘤与其宿主间的相互关系为主题，以机体的免疫生物学机能在病毒感染和肿瘤生长中的作用（即免疫生物学效应与机制）为内容，以抗病和防病的实验疗法（即免疫生物学疗法）为目的，展开新颖、独特、高效、实用的实验研究。

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