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  • 2009年全国高校硕士研究生招生简章
生化笔记--沈同二、三版
作者:未知 来源:本站社区 点击: 时间:2004-9-2


    图片:

    E.coli 具有合成各种a.a的能力。在多数情况下,只有在培养基不供应外源a.a时,才去合成产生该a.a所必须的酶系。
    当细胞内Trp浓度较高时,Trp与阻遏蛋白(trpR基因产物)结合,产使它具有活性,从而与trpO基因结合,关闭转录。
    当细胞内Trp浓度很低时,阻遏遇蛋白上的Trp解离出来,使阻遏蛋白失活,并失去与trpO结合的能力,开启转录。
    图片:
    7、 trp操纵子的前导序列
    trp mRNA分子一旦开始合成,在trpE基因开始转录之前,大多数mRNA会停止生长,这是因为前导序列(trpL)对操纵子调控发挥了重要作用。
    trp mRNA的前导序列及前导肽。
    结构基因上游具有:启动子—操纵基因—前导序列—衰减子区。
    mRNA 5,端有162b,其中139个构成前导序列。前导序列由14个a.a的前导肽、4个互补区段和1个衰减子终止点构成。
    衰减子:位于结构基因上游前导区的终止信号。
    前导序列的特点:
    ⑴前导序列的某些区段富含GC。尾部有一个含8个U的区段,易极成不依赖于ρ的终止信号。(3区与4区构成终止信号的发夹结构)
    ⑵1区和2区构成第二个发夹结构,其中1区处于14个a.a的前导肽序列中。
    ⑶3区与2区也能形成另一个发夹结构,从而可阻止3区与4区形成终止发夹结构。
    ⑷前导序列RNA编码一段14a.a的前导肽,并有一终止密码子UGA
    ⑸前导序列中,并列二个Trp密码子.
    在mRNA合成过程中,1区与2区若先配对,则3区与4区配对,终止转录.
    图片:
    阻遏和衰减机制,虽然都是在转录水平上进行调节,但是它们的作用机制完全不同,前者控制转录的起始,后者控制转录起始后是否继续下去。
    氨基酸合成操纵子前导肽序列
    P454表22-2

    生长速度调节:  严紧控制
    基因表达时序调节:
    翻译水平调节:
    二、 真核基因表达的调节

    c第十章     氨基酸代谢
    植物、微生物从环境中吸收氨、铵盐、亚硝酸盐、硝酸盐等无机氮,合成各种氨基酸、蛋白质、含氮化合物。
    人和动物消化吸收动、植物蛋白质,得到氨基酸,合成蛋白质及含氮物质。
    有些微生物能把空气中的N2转变成氨态氮,合成氨基酸。
    第一节 蛋白质消化、降解及氮平衡
    一、 蛋白质消化吸收
    哺乳动物的胃、小肠中含有胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、羧肽酶、氨肽酶、弹性蛋白酶。经上述酶的作用,蛋白质水解成游离氨基酸,在小肠被吸收。
    被吸收的氨基酸(与糖、脂一样)一般不能直接排出体外,需经历各种代谢途径。
    肠粘膜细胞还可吸收二肽或三肽,吸收作用在小肠的近端较强,因此肽的吸收先于游离氨基酸。
    二、 蛋白质的降解
    人及动物体内蛋白质处于不断降解和合成的动态平衡。成人每天有总体蛋白的1%~2%被降解、更新。
    不同蛋白的半寿期差异很大,人血浆蛋白质的t1/2约10天,肝脏的t1/2约1~8天,结缔组织蛋白的t1/2约180天,许多关键性的调节酶的t1/2 均很短。
    真核细胞中蛋白质的降解有两条途径:
    一条是不依赖ATP的途径,在溶酶体中进行,主要降解外源蛋白、膜蛋白及长寿命的细胞内蛋白。
    另一条是依赖ATP和泛素的途径,在胞质中进行,主要降解异常蛋白和短寿命蛋白,此途径在不含溶酶体的红细胞中尤为重要。
    泛素是一种8.5KD(76a.a.残基)的小分子蛋白质,普遍存在于真核细胞内。一级结构高度保守,酵母与人只相差3个a.a残基,它能与被降解的蛋白质共价结合,使后者活化,然后被蛋白酶降解。
    三、 氨基酸代谢库
    食物蛋白中,经消化而被吸收的氨基酸(外源性a.a)与体内组织蛋白降解产生的氨基酸(内源性a.a)混在一起,分布于体内各处,参与代谢,称为氨基酸代谢库。
    氨基酸代谢库以游离a.a总量计算。
    肌肉中a.a占代谢库的50%以上。
    肝脏中a.a占代谢库的10%。
    肾中a.a占代谢库的4%。
    血浆中a.a占代谢库的1~6%。
    肝、肾体积小,它们所含的a.a浓度很高,血浆a.a是体内各组织之间a.a转运的主要形式。
    氨基酸代谢库
      图

    四、 氮平衡
    食物中的含氮物质,绝大部分是蛋白质,非蛋白质的含氮物质含量很少,可以忽略不计。
    氮平衡:机体摄入的氮量和排出量,在正常情况下处于平衡状态。即,摄入氮=排出氮。
    氮正平衡:摄入氮>排出氮,部分摄入的氮用于合成体内蛋白质,儿童、孕妇。
    氮负平衡:摄入氮<排出氮。饥锇、疾病。
    第二节 氨基酸分解代谢
    氨基酸的分解代谢主要在肝脏中进行。
    氨基酸的分解代谢一般是先脱去氨基,形成的碳骨架可以被氧化成CO2和H2O,产生ATP ,也可以为糖、脂肪酸的合成提供碳架。
    一、 脱氨基作用
    主要在肝脏中进行
    (一) 氧化脱氨基
    第一步,脱氢,生成亚胺。第二步,水解。
    P219  反应式:

    生成的H2O2有毒,在过氧化氢酶催化下,生成H2O+O2↑,解除对细胞的毒害。
    1、 催化氧化脱氨基反应的酶(氨基酸氧化酶)
    (1)、 L—氨基酸氧化酶
    有两类辅酶,E—FMN
        E—FAD(人和动物)
    对下列a.a不起作用:
    Gly、β-羟氨酸(Ser、 Thr)、二羧a.a( Glu、 Asp)、二氨a.a (Lys、 Arg)
    真核生物中,真正起作用的不是L-a.a氧化酶,而是谷氨酸脱氢酶。
    (2)、 D-氨基酸氧化酶  E-FAD 
    有些细菌、霉菌和动物肝、肾细胞中有此酶,可催化D-a.a脱氨。
    (3)、 Gly氧化酶  E-FAD 
    使Gly脱氨生成乙醛酸。
    (4)、 D-Asp氧化酶  E-FAD
    E-FAD 兔肾中有D-Asp氧化酶,D-Asp脱氨,生成草酰乙酸。
    (5)、 L-Glu脱氢酶  E-NAD+    E-NADP+
    P220 反应式:

    真核细胞的Glu脱氢酶,大部分存在于线粒体基质中,是一种不需O2的脱氢酶。
    此酶是能使a.a直接脱去氨基的活力最强的酶,是一个结构很复杂的别构酶。在动、植、微生物体内都有。
    ATP、GTP、NADH可抑制此酶活性。
    ADP、GDP及某些a.a可激活此酶活性。
    因此当ATP、GTP不足时,Glu的氧化脱氨会加速进行,有利于a.a分解供能(动物体内有10%的能量来自a.a氧化)。
    (二) 非氧化脱氨基作用(大多数在微生物的中进行)
       P 221

    ①还原脱氨基(严格无氧条件下)
         图

    ②水解脱氨基
          图

    ③脱水脱氨基
         图

    ④脱巯基脱氨基

    ⑤氧化-还原脱氨基
    两个氨基酸互相发生氧化还原反应,生成有机酸、酮酸、氨。
    ⑥脱酰胺基作用
    谷胺酰胺酶:谷胺酰胺  +  H2O → 谷氨酸  +  NH3
    天冬酰胺酶:天冬酰胺  +  H2O → 天冬氨酸  +  NH3
    谷胺酰胺酶、天冬酰胺酶广泛存在于动植物和微生物中
    (三) 转氨基作用
    转氨作用是a.a脱氨的重要方式,除Gly、Lys、Thr、Pro外,a.a都能参与转氨基作用。
    转氨基作用由转氨酶催化,辅酶是维生素B6(磷酸吡哆醛、磷酸吡哆胺)。转氨酶在真核细胞的胞质、线粒体中都存在。

    转氨基作用:是α-氨基酸和α-酮酸之间氨基转移作用,结果是原来的a.a生成相应的酮酸,而原来的酮酸生成相应的氨基酸。

    P223 结构式:

    不同的转氨酶催化不同的转氨反应。
    大多数转氨酶,优先利用α-酮戊二酸作为氨基的受体,生成Glu。如丙氨酸转氨酶,可生成Glu,叫谷丙转氨酶(GPT)。肝细胞受损后,血中此酶含量大增,活性高。肝细胞正常,血中此酶含量很低。
    动物组织中,Asp转氨酶的活性最大。在大多数细胞中含量高,Asp是合成尿素时氮的供体,通过转氨作用解决氨的去向。

    转氨作用机制 P224 图16-2

    此图只画出转氨反应的一半。
    (四) 联合脱氨基
    单靠转氨基作用不能最终脱掉氨基,单靠氧化脱氨基作用也不能满足机体脱氨基的需要,因为只有Glu脱氢酶活力最高,其余L-氨基酸氧化酶的活力都低。
    机体借助联合脱氨基作用可以迅速脱去氨基 。
    1、 以谷氨酸脱氢酶为中心的联合脱氨基作用
    氨基酸的α-氨基先转到α-酮戊二酸上,生成相应的α-酮酸和Glu,然后在L-Glu脱氨酶催化下,脱氨基生成α-酮戊二酸,并释放出氨。

    P225  图16-3  以谷氨酸脱氢酶为中心的联合脱氨基作用

    2、 通过嘌呤核苷酸循环的联合脱氨基做用
           P 225结构式:次黄嘌呤核苷一磷酸(IMP)、腺苷酸代琥珀酸、腺苷酸

    P226  图16-4通过嘌呤核苷酸循环的联合脱氨基做用

    骨骼肌、心肌、肝脏、脑都是以嘌呤核苷酸循环的方式为主
    二、 脱羧作用
    生物体内大部分a.a可进行脱羧作用,生成相应的一级胺。
    a.a脱羧酶专一性很强,每一种a.a都有一种脱羧酶,辅酶都是磷酸吡哆醛。
    a.a脱羧反应广泛存在于动、植物和微生物中,有些产物具有重要生理功能,如脑组织中L-Glu脱羧生成r-氨基丁酸,是重要的神经介质。His脱羧生成组胺(又称组织胺),有降低血压的作用。Tyr脱羧生成酪胺,有升高血压的作用。
    但大多数胺类对动物有毒,体内有胺氧化酶,能将胺氧化为醛和氨。
    三、 氨的去向
    氨对生物机体有毒,特别是高等动物的脑对氨极敏感,血中1%的氨会引起中枢神经中毒,因此,脱去的氨必须排出体外。
    氨中毒的机理:脑细胞的线粒体可将氨与α-酮戊二酸作用生成Glu,大量消耗α-酮戊二酸,影响TCA,同时大量消耗NADPH,产生肝昏迷。
    氨的去向:
    (1)重新利用     合成a.a、核酸。 
    (2)贮存         Gln,Asn
    高等植物将氨基氮以Gln,Asn的形式储存在体内。
    (3)排出体外
              排氨动物:水生、海洋动物,以氨的形式排出。
            排尿酸动物:鸟类、爬虫类,以尿酸形式排出。
              排尿动物:以尿素形式排出。
    (一) 氨的转运(肝外→肝脏)
    1、 Gln转运   Gln合成酶、Gln酶(在肝中分解Gln)
    Gln合成酶,催化Glu与氨结合,生成Gln。
    Gln中性无毒,易透过细胞膜,是氨的主要运输形式。
    Gln经血液进入肝中,经Gln酶分解,生成Glu和NH3。




    2、 丙氨酸转运(Glc-Ala循环)
    肌肉可利用Ala将氨运至肝脏,这一过程称Glc-Ala循环。




    丙氨酸在PH7时接近中性,不带电荷,经血液运到肝脏



    在肌肉中,糖酵解提供丙酮酸,在肝中,丙酮酸又可生成Glc。
    肌肉运动产生大量的氨和丙酮酸,两者都要运回肝脏,而以Ala的形式运送,一举两得。
    (二) 氨的排泄
    1、 直接排氨
    排氨动物将氨以Gln形式运至排泄部位,经Gln酶分解,直接释放NH3。游离的NH3借助扩散作用直接排除体外。
    2、 尿素的生成(尿素循环)
    排尿素动物在肝脏中合成尿素的过程称尿素循环
    1932年,Krebs发现,向悬浮有肝切片的缓冲液中,加入鸟氨酸、瓜氨酸、Arg中的任一种,都可促使尿素的合成。
    尿素循环途径(鸟氨酸循环):

         P230图16-6

    (1)、 氨甲酰磷酸的生成(氨甲酰磷酸合酶I)
    肝细胞液中的a.a经转氨作用,与α-酮戊二酸生成Glu,Glu进入线粒体基质,经Glu脱氢酶作用脱下氨基,游离的氨(NH4+)与TCA循环产生的CO2反应生成氨甲酰磷酸。



    氨甲酰磷酸是高能化合物,可作为氨甲酰基的供体。
    氨甲酰磷酸合酶I:存在于线粒体中,参与尿素的合成。
    氨甲酰磷酸合酶II:存在于胞质中,参与尿嘧啶的合成。
    N-乙酰Glu激活氨甲酰磷酸合酶 I、II
    (2)、 合成瓜氨酸(鸟氨酸转氨甲酰酶)
    鸟氨酸接受氨甲酰磷酸提供的氨甲酰基,生成瓜氨酸。

    P231  反应式:

    鸟氨酸转氨甲酰酶存在于线粒体中,需要Mg2+作为辅因子。
    瓜氨酸形成后就离开线粒体,进入细胞液。
    (3)、 合成精氨琥珀酸(精氨琥珀酸合酶)



    P231  结构式
    (4)、 精氨琥珀酸裂解成精氨酸和延胡索素酸(精氨琥珀酸裂解酶)

    精氨琥珀酸  → 精氨酸 + 延胡索素酸

    P232 结构式

    此时Asp的氨基转移到Arg上。
    来自Asp的碳架被保留下来,生成延胡索酸。延胡索素酸可以经苹果酸、草酰乙酸再生为天冬氨酸, 
    (5)、 精氨酸水解生成鸟氨酸和尿素
    P232结构式

    尿素形成后由血液运到肾脏随尿排除。

    尿素循环总反应:
    NH4+ + CO2 + 3ATP + Asp + 2H2O  →  尿素 + 2ADP + 2Pi + AMP + Ppi + 延胡索酸

    形成一分子尿素可清除2分子氨及一分子CO2 , 消耗4个高能磷酸键。


        联合脱-NH2合成尿素是解决-NH2去向的主要途径。
        尿素循环与TCA的关系:草酰乙酸、延胡素酸(联系物)。
        肝昏迷(血氨升高,使α-酮戊二酸下降,TCA受阻)可加Asp或Arg缓解。
    3、 生成尿酸(见核苷酸代谢)
    尿酸(包括尿素)也是嘌呤代谢的终产物。
    四、 氨基酸碳架的去向
    20种aa有三种去路
    (1)氨基化还原成氨基酸。
    (2)氧化成CO2和水(TCA)。
    (3)生糖、生脂。
    20种a.a的碳架可转化成7种物质:丙酮酸、乙酰CoA、乙酰乙酰CoA、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸、草酰乙酸。
    它们最后集中为5种物质进入TCA:乙酰CoA、α-酮戊二酸、琥珀酰CoA、延胡索酸、草酰乙酸。

    234  图 16-7 氨基酸碳骨架进入TCA的途径
    1、 转变成丙酮酸的途径
    P236 图16-8     Ala、Gly、Ser、Thr、Cys形成丙酮酸的途径

    (1)、 Ala  经与α-酮戊二酸转氨(谷丙转氨酶)



    (2)、 Gly先转变成Ser,再由Ser转变成丙酮酸。



    Gly与Ser的互变是极为灵活的,该反应也是Ser生物合成的重要途径。
    Gly的分解代谢不是以形成乙酰CoA为主要途径,Gly的重要作用是一碳单位的提供者。
        Gly  +  FH4  +  NAD+  →  N5,N10-甲烯基FH4  +  CO2  +  NH4+  +  NADH
    (3)、 Ser   脱水、脱氢,生成丙酮酸(丝氨酸脱水酶)

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