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五、 温度对酶促反应速度的影响。
1.最适温度及影响因素
温度对酶促反应速度的影响有两个方面:
①提高温度,加快反应速度。
②提高温度,酶变性失活。
这两种因素共同作用,在小于最适温度时,前一种因素为主;在大于最适温度时,后一种因素为主。最适温度就是这两种因素综合作用的结果。
温度系数Q10:温度升高10℃,反应速度与原来的反应速度之比,Q10一般为1~2。
温血动物的酶,最适温度35℃—40℃,植物酶最适温度40℃—50℃,细菌Taq DNA聚合酶70℃。
2.酶的稳定性温度
在某一时间范围内,酶活性不降低的最高温度称该酶的稳定性温度。
酶的稳定性温度有一定的时间限制。
稳定性温度范围的确定方法:将酶分别在不同温度下预保温一定时间,然后回到较低温度(即酶的热变性失活作用可忽略的温度),测酶活性。
图
酶浓度高、不纯、有底物、抑制剂和保护剂会使稳定性温度增高。
酶的保存:
①液体酶制剂可以利用上述5种因素中的几种,低温(几个月)。
②干粉,可在室温下放置一段时间,长期保存,应在低温冰箱中。
六、 酶浓度对酶促反应速度的影响
如果底物浓度足够大,使酶饱和,则反应速度与酶浓度成正比。
Vmax = K3 [E]
[S]过量且不变时,v∝[E]。
七、 激活剂对酶促反应速度的影响
凡是能提高酶活性的物质,都称为激活剂。activator
激活剂作用包括两种情况:
一种是由于激活剂的存在,使一些本来有活性的酶活性进一步提高,这一类激活剂主要是离子或简单有机化合物。
另一种是激活酶原,无活性→有活性,这一类激活剂可能是离子或蛋白质。
1、 无机离子的激活作用
(1)金属离子:K+ 、Na+、Mg2+ 、Zn2+、Fe 2+ 、Ca2+
(2)阴离子:cl-、Br -
(3)氢离子
许多金属离子是酶的辅助因子,是酶的组成成分,参与催化反应中的电子传递。
有些金属离子可与酶分子肽链上侧链基团结合,稳定酶分子的活性构象。
有的金属离子通过生成螯合物,在酶与底物结合中起桥梁作用。
注意:
(1) 无机离子的激活作用具有选择性,不同的离子激活不同的酶。
(2) 不同离子之间有拮抗作用,如Na+与K+、Mg+与Ca+,但Mg+与Zn+常可替代。
(3) 激活剂的浓度要适中,过高往往有抑制作用,1~50mM
2、 简单有机分子的激活作用
①还原剂(如Cys、还原型谷胱甘肽)能激活某些活性中心含有—SH的酶。
②金属螯合剂(EDTA)能去除酶中重金属离子,解除抑制作用。
抑制剂对酶促反应速度的影响
酶是protein ,凡可使酶蛋白变性而引起酶活力丧失的作用称为酶的失活作用。
抑制作用:使酶活力下降但并不引起酶蛋白变性的作用称为抑制作用。(不可逆抑制、可逆抑制)
抑制剂(inhibitor):不引起酶蛋白变性,但能使酶分子上某些必需基团(活性中心上一些基团)发生变化,引起酶活性下降,甚至丧失,此类物质称为酶的抑制剂。
研究抑制剂对酶的作用有重大的意义:
(1) 药物作用机理和抑制剂型药物的设计与开发:抗癌药
(2) 对生物体的代谢途径进行认为调控,代谢控制发酵
(3) 研究酶的活性中心的构象及其化学功能基团,不仅可以设计农药,而且也是酶工程和化学修饰酶、酶工业的基础
(一) 不可逆抑制作用(非专性必、专一性)
抑制剂与酶活性中心基团共价结合,使酶的活性下降,无法用透析法除去抑制剂。
1、 非专一性不可逆抑制剂
此类抑制剂可以和一类或几类基团反应。它们不但能和酶分子中的必需基团作用,同时也能和相应的非必需基团作用。
(1)、 酰化剂
二异丙基磷酰氟酯(DFP,神经毒气)和许多有机磷农药都属于磷酰化剂,能与酶活性中心Ser的—OH结合,抑制某些蛋白酶及酯酶。这类化合物的作用机理是强烈地抑制与中枢神经系统有关的乙酰胆碱脂酶,使乙酰胆碱不能分解为乙酰和胆碱。乙酰胆碱的堆积,引起一系列神经中毒症状。
P258 结构式:磷酰化剂与DFP
P259 反应式:磷酰化剂与胆碱酯酶形成磷酰化胆碱酯酶
解毒剂:PAM(解磷定),可以把酶上的磷酸根除去。
(2)、 烷化剂
许多有机汞、有机砷都是烷化剂,可以使酶的巯基烷化
P259 反应式:对氯汞苯甲酸与巯基酶的反应
有机汞、有机砷化合物和重金属还可以与还原型硫辛酸(人体重要的辅酶)反应
解毒剂:二巯基丙醇
(3)、 氰化物
与含铁扑啉的酶中的Fe2+结合,阻抑细胞呼吸。
(4)、 重金属
Ag、Cu、Hg、Cd、Pb能使大多数酶失活,EDTA可解除。
(5)、 还原剂
以二硫键为必需基团的酶,可以被巯基乙醇、二硫苏糖醇等巯基试剂还原失活。
(6)、 含活泼双键试剂(与—SH、—NH2反应)
N—乙基顺丁烯二酰亚胺
图
(7)、 亲电试剂
四硝基甲烷,可使Tyr硝基化。
图
2、 专一性不可逆抑制
此类抑制剂仅仅和活性部位的有关基团反应。
(1)、 Ks型专一性不可逆抑制剂
Ks型抑制剂不仅具有与底物相似的、可与酶结合的基团,同时还有一个能与酶的其它基团反应的活泼基团。
专一性:抑制剂与酶活性部位某基团形成的非共价络合物和抑制剂与非活性部位同类基团形成的非共价络合物之间的解离常数不同。
举例:
胰凝乳蛋白酶的Ks型不可逆抑制剂:对一甲苯磺酰-L-苯丙氨酰氯甲烷(TPCK)与该酶的最佳底物对-甲苯磺酰-L-苯丙氨酸甲酯的结构相似,都含有对-甲苯磺酰-L-苯丙氨酰基,酶通过对这个基团的强亲和力,把TPCK误认为底物而与之结合,形成Ks很小的非共价络合物。
《酶学》P119
最佳底物 TPCK
-CH2-cl与酶活性部位的一个His-咪唑基距离很近,很易使之烷基化,而非活性部位的咪唑基,由于远离-CH2-cl,则不被烷基化。
(2)、 Kcat型专一性不可逆抑制剂
这种抑制剂是根据酶的催化过程来设计的,它们与底物类似,既能与酶结合,也能被催化发生反应,在其分子中具有潜伏反应基团(latent reactive group),该基团会被酶催化而活化,并立即与酶活性中心某基团进行不可逆结合,使酶受抑制。此种抑制专一性强,又是经酶催化后引起,被称为自杀性底物。
举例1:
β-羟基癸酰硫酯脱水酶的Kcat型不可逆抑制剂:CH3(CH2)5-C=C-CH2-CO-S-R
此酶催化的反应:
P260反应式
当有Kcat抑制剂时,此抑制剂被催化生成连丙二烯结构,连丙二烯易与His咪唑反应,使酶失活。
P261反应式
举例2:
以FMN(黄素单核苷酸)、FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)为辅基的单胺氧化酶的Kcat型不可逆抑制剂;炔类化合物。
迫降灵是一种单胺氧化酶的自杀性底物,是治疗高血压的良药。
图
单胺氧化酶能氧化某些血管舒张剂(如组胺)
图
由于迫降灵能抑制单胺氧化酶,也就能抑制一些血管舒张剂(如组胺)的氧化,因而有降血压的作用。
Kcat型专一性不可逆抑制剂的专一性很强,近来已设计出多种酶的Kcat逆制剂,在医疗方面起到很大作用。
(二) 可逆抑制作用 Reversible Inhibition
此类抑制剂与酶蛋白的结合是可逆的,可以用透折法除去抑制剂,恢复酶的活性。
1、 竞争性抑制(Competitive inhibition)
抑制剂与底物竞争酶的活性中心。
竞争性抑制剂具有与底物类似的结构,可与酶形成可逆的EI复合物,阻止底物与酶结合。可以通过增加底物浓度而解除此种抑制。
P258 图4-11 酶与底物及竞争性、非竞争性抑制剂结合的模型
举例1:丙二酸抑制琥珀酸脱氢酶
举例2:磺胺类药物及其作用机理
磺胺类药物可以抑制细菌的生长繁殖,治疗细菌引起的各种疾病。
磺胺类药物是对氨基苯磺酰胺或其衍生物,它是对氨基苯甲酸的结构类似物,竞争性抑制二氢叶酸合成酶
P261 结构式:对氨基苯甲酸 对氨基苯磺酰胺 叶酸
磺胺类药物的药理(对氨基苯磺酰胺):
嘌呤核苷酸的合成必需要由四氢叶酸(辅酶)提供一碳单位;四氢叶酸可由二氢叶酸或叶酸转化而成;二氢叶酸是在二氢叶酸合成酶作用下,利用蝶呤、对氨基苯甲酸及Glu合成。
动物体内的叶酸可从食物中获取,细菌体内的叶酸只能在二氢叶酸合成酶作用下,利用对氨基苯甲酸合成。
如果动物体内含有大量的对氨基苯磺酰胺,可与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶的活性中心,抑制细菌二氢叶酸合成。
2、 非竞争性抑制
特点:抑制剂与酶活性中的以外的基团结合,其结构可能与底物无关。
酶可以同时与底物及抑制剂结合,但是,中间产物ESI不能进一步分解为产物,因此,酶的活性降低。显然,不能通过增加底物的浓度的办法来消除非竞争性抑制作用。
非竞争性抑制剂多是与酶活性中心之外的巯基可逆结合,包括某些含金属离子的化合物(Cu2+、Hg2+、Ag+)和EDTA,。
3、 反竞争性抑制
酶只有在与底物结合后,才能与抑制剂结合。E+S→ES+I ≠ P
(三) 可逆抑制作用的动力学
用书上P263-266的方法可推出三种抑制方程。
1、 竞争性抑制:
动力学方程:
竞争性抑制曲线:
P263 图4-12竞争性抑制曲线
竞争性抑制作用小结:
(1) Vmax不变,Km变大。要达到同一个给定的Vmax分数,必须要有比无抑制剂时大得多的底物浓度。
(2) 竞争性抑制剂对酶促反应的抑制程度,决定于[I]、[S]、Km和Ki
A. [I]一定,增加[S],可减少抑制程度。
B. [S]一定,增加[I],可增加抑制程度(Km’增加)。
C. Ki值较低时,任何给定[I]和[S],抑制程度都较大,Ki越大,抑制作用越小。
D. [I]=Ki时,所作双倒数图直线的斜率加倍。
E. 在一定[S]、[I]下,Km值愈低,抑制程度愈小。
2、 非竞争性抑制
动力学方程:
相对速度:
抑制分数:
非竞争抑制曲线:
P265 图4-13
非竞争性抑制剂可使酶促反应的Vmax降至Vmax/(1+[I]/Ki),而对Km无影响。它对酶促反应的抑制程度决定于[I]和Ki ,与酶的Km和[S]无关。
3、 反竞争性抑制
动力学方程:
相对速度:
抑制分数:
P265 图4-14 反竞争抑制曲线
在反竞争性抑制作用下,Km及Vmax都变小,且Km’
P266 表4-7 小结: 三种可逆抑制作用的酶促反应速度V与Km值
九、 有机介质中的酶促反应(只是一部分酶)
传统观点:酶是水溶性生物大分子,只能在水介质中进行催化反应,有机介质会使酶变性。
其实在细胞中,许多生物膜上的酶就是在低极性的微环境中发挥催化功能的。
优点: ①利于疏水性底物的反应。
②可提高酶的热稳定性,提高催化温度。
③能催化在水中不能进行的反应。
④可改变反应平衡移动方向。
⑤可控制底物专一性。
⑥防止由水引起的副反应。
⑦可扩大pH值的适应性等等。
1、 有机介质中酶促反应的条件
(1)、 必需水(结合水)
酶催化活性所必需的构象,是由水分子直接或间接地通过氢键等非共价相互作用来维持的,因此只有与酶分子紧密结合的单层水分子,对酶的催化活性才是至关重要的。
这紧紧吸附在酶分子表面,维持酶催化活性所必需的最少量的水称为必需水(或结合水、束缚水)。
酶的活性由必需水决定,而与溶剂里的水含量无关,只要必需水不丢失,其它大部分水即使都被有机溶剂取代,酶仍然保持其催化活性。
因此,可把有机介质中酶促反应理解为宏观上是在有机介质中,而在微观上仍是水中的酶促反应。正因如此,才能使用有机介质代替水溶液,进行酶促反应。
一个干燥的酶水合: 吸附水量:
酶分子表面电荷基团: 0-0.07g/g (水/酶)
酶分子表面极性基团: 0.07-0.25g/g
弱极性、非极性基团: 0.25-0.28g/g
表面完全水化,被一层水分子包围。
酶的必需水含量因酶而异。
脂肪酶:几个水分子/每个酶分子
胰凝乳蛋白酶:50个水分子/每个酶分子
乙醇脱氢酶:几百个水分子/每个酶分子
(2)、 对酶的要求
具有对抗有机介质变性的经能力。
(3)、 合适的溶剂及反应体系
(4)、 合适的pH
保证有机介质中酶的微环境具有最适pH值。酶应从具有最适pH值的缓冲液中冻干或沉淀出来。
2、 有机介质对酶性质的影响
(1)、 稳定性
大多数酶在低水有机介质中比在水介质中更稳定。
a. 热稳定性提高
例如:猪胰脂肪酶在醇和酯中进行催化反应,在100℃半衰期长达12h,其活性比25℃时还高几倍
b. 储存稳定性提高
胰凝乳蛋白酶在20℃时,在水中半衰期只几天。在辛烷中,可放6个月,仍保持全部活性。
(2)、 活性
有两类影响 升高活性
降低活性
酶的超活性:高于水溶液中酶活性值的活性。
(3)、 专一性
某些有机溶剂会使某些酶的专一性发生变化,如脂肪酶在有机介质中有合成肽键的功能。星号活力(第二活力)。
(4)、 反应平衡
有机介质能改变某些酶催化的反应平衡。
例如:水解酶类(蛋白水解酶)
在水介质中,水的浓度为55.5mol/L,平衡趋向水解方向,
如在含水量极低的有机介质中,平衡向含成方向偏移。
实例:(酶) 合成)产物 溶剂 合成收率
枯草杆菌蛋白酶 核糖核酸酶 甘油90% 50%
无色杆菌蛋白酶 胰岛素 乙醇30% 80%
凝血酶 人生长素 甘油80% 20%
(5)、 分子印迹和pH记忆
酶在冻干前可用配体作印迹。
竞争性抑制剂,可诱导酶活性中心构象发生变化,形成一种高活性构象,而此种构象在除去抑制剂后,因酶在有机介质中的高度刚性而得到保持。
pH记忆:
酶在有机介质中能“记住”它最后存在过的水溶液的pH值,因该pH值决定了酶分子上有关基团的解离状态,这种状态在冻干过程和分散到有机介质中之后仍得到保持。
第四节 酶的作用机理
一、 专一性的机理
(一) 酶专一性类型
一般说来,一种分子能成为某种酶的底物,必须具备两个条件:
分子上有被酶作用的化学键。
分子上有一个或多个结合基团能与酶活性中心结合。
2003-2-15 11:39:48
上官婉儿
头衔:军师
等级:版主
文章:475
积分:4973
门派:生物学
注册:2002-9-29
第20楼
2、 诱导楔合模型
酶分子与底物分子接近时,酶蛋白质受底物分子诱导,构象发生有利于与底物结合的变化,酶与底物在此基础上互补楔合,进行反应。
P271 图4—18
二、 高效性的机理
1、 邻近效应与定向效应
酶把底物分子(一种或两种)从溶液中富集出来,使它们固定在活性中心附近,反应基团相互邻近,同时使反应基团的分子轨道以正确方位相互交叠,反应易于发生。
两种效应对反应速度的影响
①使底物浓度在活性中心附近很高
甚至比溶液中高10万倍,提高反应速度。
②酶对底物分子的电子轨道具有导向作用
举例:酚羟基和羧基环化成内酸
图
3个CH3固定了-OH和-COOH的相对方位。
③酶使分子间反应转变成分子内反应
反应速度提高:107
图
④邻近效应和定向效应对底物起固定作用
酶底复合物寿命比一般双分子相互碰撞的平均寿命长,前者10-7-10-4秒,后者10-13秒,增大了产物形成的机率。
2、 扭曲变形和构象变化的催化效应
酶中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子云密度变化,产生电子张力。
P276 图4-20
环状反应物I水解开环,环扭曲能量大量释放,加速反应。
底物与酶蛋白接触,加速反应。
①酶从低活性形式转变为高活性形式
②底物扭曲、变形
③底物构象变化,变得更像过度态结构,大大降低活化能。
3、 共价催化
酶作为亲核基团或亲电基团,与底物形成一个反应活性很高的共价中间物,此中间物易变成过渡态,反应活化能大大降低,提高反应速度。
①亲核共价催化
丝氨酸羟基、Cys的-SH、His的咪唑基。
举例:咪唑基催化对硝基苯乙酸酯水解。
图
②亲电共价催化
亲电基团攻击底物的富电子基团
例:Asp转氨酶催化Asp 转氨反应
图
P278 表4-13 形成共价ES复合物的某些酶
4、 酸碱催化
酶分子的一些功能基团起质子供体或质子受体的作用。
参与酸碱催化的基团:氨基、羧基、巯基、酚羟基、咪唑基。
P279 表4-14 酶分子中可作为广义酸碱的功能基团
影响酸碱催化反应速度的两个因素
⑴酸碱强度,咪唑基在pH6附近给出质子和结合质子能力相同,是最活泼的催化基团。
⑵给出质子或结合质子的速度,咪唑基最快
①酸催化酯、酰胺和肽的水解
图
过程:共轭酸与>C=0氧形成氢键,使>C=0碳带更多正电荷,更易吸引H2O分子上的氧,降低>C=0碳与H2O氧形成共价键的活化能;接着,共轭酸将H+转移给>C=0氧,自己成为共轭碱,并从H2O分子吸引一个H+, 回复原状。
②碱催化酯、酰胺水解
图
过程:共轭碱先与H2O中H形成氢键,使H2O中氧的电负性增强,更易对>C=0碳进行亲核进攻,降低碳氧键生成的活化能。
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