注意：
a)可以在加样孔中加入0.5×TBE，利用毛细作用将胶块沉在加样孔底，尽量避免气泡形成。
b)记录加样顺序。
六、电泳
1、确保电泳槽是水平的。如果不水平，调整槽底部的旋钮。注意：不要触
碰电极。
2、加入2.2L 0.5×TBE,关上盖子。
3、打开主机和泵的开关，确保泵设在－70(这时缓冲液的流速约1L/分钟)
和缓冲液在管道中正常循环。
4、打开冷凝机，确保预设温度在14℃(缓冲液达到该温度通常需要20分钟左右)。
5、打开胶槽的旋钮，取出凝固好的胶，用吸水纸清除胶四周和底面多余的胶，小心的把胶放入电泳槽，关上盖子。
6、设置电泳参数。
7、记录电泳初始电流(通常120－145ma)。
8、结束电泳：关机顺序为：冷凝机－泵－主机。
七、图像的获取
1、取出胶，放在盛放400ml EB溶液的托盘内(EB储存液浓度为10mg/ml，
1：10,000稀释，即在400ml水中加入40µl储存液)。
注意：
EB是致畸剂。储存在棕色瓶中的EB稀释液可以用3-5次。废弃的EB溶液应妥善处理。
2、将托盘放在摇床上摇25-30分钟。
3、放掉电泳槽中的TBE，用1-2L纯水清洗电泳槽，并倒掉液体。
4、戴上手套将用后的EB溶液小心倒入做有标记的棕色瓶中，在托盘中加
入400-500ml纯水，放在摇床上脱色60-90分钟，如果可能每20-30分钟换一次纯水。
5、用Gel Doc 2000拍摄图像。
注意：如果背景干扰分析，可进一步脱色30-60分钟。
6、转换成*.1sc文件用于处理分析。
八、数据的分析
图像的读取
电泳图像通常用BIO-RAD的GEL DOC 2000或其它成像系统来获取。其它可以替代的成像设备，只要具有CCD相机，可以提供IBM兼容的未压缩的TIFF图像，且分辨力≥768 x 640像素，能够用BioNumerics software (Applied Maths, Inc.)软件与PulseNet数据库中其它图像进行对比分析，也可以运用。
运用GEL DOC 2000的简单说明：
QUANTITY ONE软件
1、点击QUANTITY ONE按钮打开该软件。
2、点击菜单FILE→GEL DOC。
注意：需要10－20秒打开窗口。
3、打开抽屉，把胶放在台板上。胶已经经过EB或GEL-STAR染色并经过充分脱色。用黑色胶框把胶放在合适的位置。关上抽屉门。
图像的获取
1、按下EPI-LIGHT按钮打开白光。
2、把胶放在调准网格线内，使胶的加样孔和调准网格线的最上面一条蓝线对齐。
3、保证调准网格线和过饱和按钮被选中。
4、改变镜头的MIDDLE RING以调整图像的大(顺时针)小(逆时针)，使图像占据整个窗口。如果需要，挪动胶在台板上的位置。胶的加样孔、下边界和左右边界在屏幕上都应该可以看到。
5、如果需要，按BOTTOM RING以调整相机的焦距。
注意：焦距的调整只可以偶尔用之，不可用于每一块胶。可以用尺子帮助调整焦距。
6、按下EPI-LIGHT关掉白光，按下UV按钮打开透射紫外光。
7、点击AUTO EXPOSE以确定大概的曝光时间。当图像出现在窗口时，AUTO EXPOSE自动关闭而MANUAL EXPOSE被激活。
8、点击MANUAL EXPOSE的↑↓按钮，调整曝光时间。而调整饱和度时，点击箭头或TURN THE TOP RING以降低光量(如果图像过饱和，图像显现红色)。
注意：如果出现对话框“曝光可以在0.03－360秒之间波动”，则需通过改变相机的像素以调整饱和度。调整饱和度使样品条带没有红色很重要，因为这会影响BIONUMERICS软件对胶图像的分析。而胶加样孔的过饱和属于正常现象。
9、当图像调整的比较满意时，按下FREEZE按钮停止曝光过程。按下UV按钮关掉紫外光(如果开门时UV灯打开，它会自动关闭)。
