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荧光定量PCR仪的选购
作者:田云 来源:生物秀 时间:2006-12-24

    (2)另一类是空气加热。用空气做介质有优点,与反应体系无缝接触,但是空气的导热性差、比热小的弱点也很明显。
    Roche罗氏诊断主推LightCycler和LightCycler2.0 2种荧光定量PCR仪。2oo5年7月份正在全新推出新一代高通量的LightCycler® 480 system。LightCycler2.0已由LightCycler的3个荧光检测通道升级为6个荧光检测通道,独特的离心、空气加热、毛细管等设计,使其成为很有特色的PCR仪。空气加热通过离心使空气流动,增强导热性,同时使用毛细管,加大接触面积、试剂微量化来弥补不足。加样量的多少对于反应的结果是有影响的,加样量越大,空气比热小的弱点就越明显,所以空气加热的仪器标本量都比较小。使用毛细吸管,试剂的专一性高,通用性差。LightCycler®480是一款针对高通量实验需要而设计开发的创新一代96/384互换式实
    时荧光定量系统,秉承了LightCycler系列一贯的高速、准确的特质,采用革新的Therma—BaseTM模块加热技术和独特快速散热装置,确保了孑L间温度的均一性;同时匹配以先进光学检测系统,确保信号的整体采集和检测灵敏度最大化,消除了传统模块加热式系统中的“边界效应”;具有5个激发光道。6个检测通道。

    Corbett的Roar—Gene也是离心式、空气加热的定量PCR仪。Corbett的Rotor-Gene3000标准型是真正独立的4通道(可建立新通道),4个独立LED激发光源(470rim/530nm/585nm/625nm),保证最少的光谱交叉(<1%)。PMT检测,6个检测滤光片,可检测荧光包括FAM/SYBR Green I、TET、VIC/JOE、HEX、Max、NED/TAMRA/Cy3、ROX/Texas Red和Cy5,Cy5.5等,机器的适用性非常宽,开放的试剂系统使得机器可适用Taqman探针、荧光染料SYBR Green I检测、分子信标、FRET探针等。Rotor-Gene3000灵敏度高,宽达12个数量级的线性范围,可正确区分1、2、3个拷贝的基因,重复性极佳(R>0.99935)。由于转子在反应过程之中一直以恒定的低速旋转,使得样品间的温度均一性极佳,同一热反应室提供完全相同的反应条件,同一光学通路提供完全相同的测量通道,每标本每循环检测32次,满足高精度和一致性要求。Rotor-Gene3000提供了36x0.2ml和72x0.1ml 2种转子,检测是通过薄壁管侧壁而非管底进行的,因而可以使用普通的0.2ml PCR管,并允许在试管盖上标记,这降低了使用成本。Rotor—Gene3000的温控速度不如Light.Cycler,但优于多数的固定加热模块的机型,能达到5℃,8(管内实际升温速度达到2.5℃/s)。Corbett还有一个光学变性专
    利——让待扩增样品预先进行一次熔解曲线程序,检测荧光染料信号大小的变化,找到代表全部双链DNA解链的峰值对应温度,在其后的反应中就无需总是将变性温度设为94。,也不需要延长孵育时间。这个专利使得反应过程大大缩短。Rotor-Gene主要的问题也是可容纳的样品数量少,只能靠反应速度快,同样的时间可以多运行几轮反应来弥补。

    2 选购PCR仪的关键因素
    除了PCR仪的性能外,仍有一些关键因素是不能被忽视的,主要有:
    (1)仪器的检测量。针对不同的实验目的(检测数量的大小,检测时间的长短、检测项目的多少、仪器的多少等),应配备不同检测量的PCR仪。在上面所述的几种PCR仪中,ABI的Prism®7000、7300和7500;Bio—Rad(伯乐)公司的iCycler iQ;MJ的Opticon、Opticon2和chromo4;Cepheid公司的Smart CycledI可一次容纳96个样品。Corbett的Rotor-Gene3000每次的最大样本数为36(0.2m1)或72(0.1m1),LightCycler2.0的每次最大样本
    数为32个。ABI的Prism® 7900HT,Roehel~LightCyeler~ 480可同时检测96/384个样品,对于需要高通量的实验具有很大的应用价值。
    (2)仪器的灵活性。针对多数科研实验室的仪器使用频率高、时间长的问题,仪器的灵活性就显得至关重要。如何能够充分利用人力与物力的问题就摆在了我们面前,此时Cepheid公司的Smart CyclerII不失为明智的选择,其允许不同条件的PCR反应同时进行的优点也就格外突出。
    (3)仪器的检测通道。目前,复合PCR实验已成为一种流行趋势,它能节省试剂和时间,在短时间内获得结果。其中罗氏的LightCycler2.0和LightCyclerR480具有6个检测通道,剩下的仪器则以4通道检测的居多。
    (4)仪器的温度梯度功能。新的定量PCR实验方法的建立,往往离不开反应条件的优化。梯度PCR可以对解链、退火和延伸均设置温度梯度,使你在摸索实验条件时,将本应进行的多次实验简化为一次,大大缩短实验时间。
    (5)耗材、试剂的开放性。耗材、试剂的开放性可显著降低实验成本。上述仪器中,Roche使用的耗材的通用性差,成本高(毛细管),且每次的检测数量低,在高样品量时,无疑叉增加了阴、阳性样品的费用。
    参考文献
    1 Higuchi R.Kinetic PCR alysis real-time monitoring of DNA amplification
    reactions.Bioteehnology,1993,1 1(9):1026~1030

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