荧光显微镜和普通显微镜有以下的区别：
1. 照明方式通常为落射式，即光源通过物镜投射于样品上（图2-3）；
2. 光源为紫外光，波长较短，分辨力高于普通显微镜；
3. 有两个特殊的滤光片，光源前的用以滤除可见光，目镜和物镜之间的用于滤除紫外线，用以保护人目。
图2-4 荧光显微镜照片（微管呈绿色、微丝红色、核蓝色），图片来自http://www.itg.uiuc.edu
（三）、激光共聚焦扫描显微境
图2-5 激光共聚焦扫描显微镜
图2-6 LCSM照片，蓝色为细胞核，绿色为微管，图片来自http://www.itg.uiuc.edu