DNA的复制实际上就是以DNA为模板在DNA聚合酶作用下,将游离的四种脱氧单核苷酸(dATP,dGTP,dCTP,dTTP,简写为dNTP)聚合成DNA的过程。这是一个非常复杂的酶促反应,需要许多种酶和蛋白质参与,现分别叙述它们在DNA复制中作用。
(一)DNA的聚合反应和DNA聚合酶
1957年,Arthur kornberg首次在大肠杆菌中发现DNA聚合酶Ⅰ,(DNA polymerase Ⅰ,简写DNA polⅠ)后来又相继发现了DNA聚合酶Ⅱ和DNA聚合酶Ⅲ。(DNA polymerase Ⅱ,Ⅲ,简写DNA polⅡ,DNA polⅢ)实验证明大肠杆菌中DNA复制的主要过程靠DNA polⅢ起作用,而DNA polⅠ和DNA polⅡ在DNA错配的校正和修复中起作用。
这种酶的共同性质是:1)需要DNA模板,因此这类酶又称为依赖DNA的DNA聚合酶(DNA dependent DNA polymerase, DDDP);2)需要RNA或DNA做为引物(primer),即DNA聚合酶不能从头催化DNA的起始;3)催化dNTP加到引物的3’-OH末端,因而DNA合成的方向是5’→3’;4)三种DNA聚合酶都属于多功能酶,它们在DNA复制和修复过程的不同阶段发挥作用。由于DNA聚合酶Ⅰ是研究得最清楚而且代表了其他DNA聚合酶的基本特点,所以我们着重介绍DNA polⅠ的作用并指出另外二种DNA pol的特殊性。
1. DNA聚合酶Ⅰ
DNA polⅠ是由一条多肽链组成,分子量为109KD。酶分子中含有一个Zn2+,是聚合活性必须的。
大肠杆菌每个细胞中约有400个酶分子,每个酶分子每分钟在37℃下能催化667个核苷酸参入到DNA链中,用枯草杆菌蛋白酶可将此酶水介成两个片段,大片段分子量为76KD,通常称为klenow片段,小片段为34KD。大小片段具有不同的酶活性。
1)DNA聚合酶的5’→3’聚合活性
这是DNA聚合酶最主要的活性,按模板DNA上的核苷酸顺序,将互补的dNTP逐个加到引物RNA3’-OH末端,并促进3’-OH与dNTP的5’-PO4形成磷酸二酯键,酶的专一性表现为新进入的dNTP必须与模板DNA碱基配对时才有催化作用,5’→3’聚合活性存在于klenow片段上(如右图)。
2)DNA聚合酶的3’→5’外切核酸酶活性
这种酶活性的主要功能是从3’→5’方向识别并切除DNA生长链末端与模板DNA不配对而游离的核苷酸,这种功能称为校对功能,这是保证其聚合作用的正确性不可缺少的,因此对于DNA复制中极高的保真性是至关重要的(如右图)。
