典型的反转录病毒含有3-4个“基因”, 是由gag-po1-env组成的。每一个基因所编码的肽链经加工后可产生多种蛋白。
反转录病毒mRNA具有常规的结构:在5′端有帽结构,在3′端有多聚腺苷的尾巴。它存在两种mRNA:长的mRNA翻译Gag和Po1多蛋白。从起始密码子到第一个终止密码的阅读框翻译成Gag产物。Po1表达一定要越过第一个终止密码子。
不同的病毒采用不同的机制来越过第一个终止密码子,它取决于gag和po1两个阅读框之间的关系。当gag和po1需要连续的时候,通过可识别此终止密码子的Glu-tRNA来抑制,产生单个的一个蛋白。当gag和po1在不同续框中,核糖体发生移框来产生单个的蛋白。通常连续率约在5%,因此Gag蛋白在数量上胜过Gag-po1蛋白约20倍。
Env多蛋白是通过另一种机制进行表达,它是将mRNA重新拼接成一个短的亚
基因组的(subgenmic)信使,翻译成Env产物。
Gag或Gag-po1和Env两者的产生是多蛋白(polyprotion),它能被蛋白水解酶切成单个的各种蛋白,存在于成熟的的病毒中,这种蛋白酶的活性是由病毒的各种形式编码的。它可能是gag或po1的一部分,有时又可以一个独立的附加读框存在。
反转录颗粒的产物涉及到将RNA包装进核心蛋白中,外周包以衣壳蛋白和从宿主细胞膜上取下的片断。病毒是通过和一个新的宿主细胞质膜的融合来感染的,然后将病毒粒子的内容物释放到宿主细胞中。