第一节 微生物的分类单位
一、种以上的分类单位
（一）七级分类单位
号（kingdom）（拉：Regnum）
门（Phylum）（拉：Phylum）或Division（拉：Divisio）
纲（class）（拉：classis）
目（order）（拉：order）
科（Family）（拉：Family）
属（Genus）（拉：Genus）
种（Species）（拉：Species）
（二）种的概念
（一）亚种（Subspecies, subsp., SSP.）
（二）变种（Variety, Var.）
（三）型（form）
（四）类群（group）
（五）菌株（strain）
第二节 微生物的命名
微生物名称：俗名common name
学名scientific name
学名：按照《国际的菌命名法规》命名，国际学术具公认并通用的正式名字。命名原则：双名法，由瑞典林奈氏（Linnaeus）提出的。即： 学名=属名+种名+首次定名人+现名定名人+定名年份
1、属名：拉丁词、希腊词或拉丁化学的其它外来词所构成为名词。表示该属的特征；有时可用人或地名。
2、种名：拉丁语中的形容词，也可用人名或地名表示。
举例说明
3、亚种或多种：属名+种名+subsp或Var.+ 种（或复种）的加词
4、某属中一个种或几个种时，属后加sp.或SPP.
第三节 微生物的分类系统
一、原核生物分类系统（细菌、放线菌、蓝细菌，支原体、衣原体、立克次氏体等）
《伯杰氏细菌鉴定手册》（Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology）（1923-1974的1-8版）
《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of systematic Bocteriology, 1984）
二、真菌的分类系统（酵母菌、霉菌、食用真菌、原生动物、薄类等）
Ainswerth(1973)的分类系统。（Ainsuorth and Bisby’s的《真菌学辞典》《Dictionary of the Fungi, Sixth.edition, 1971》）
第四节 微生物的鉴定
鉴定步骤：①获得该微生物的纯种培养物（pure culture）；②测定一系列必要的鉴定指标；③查找权威性的鉴定手册。
一、经典分类鉴定方法
形态；生理、生化反应；生态特性；生活史特点；血清学反应（免疫学鉴定）；噬菌体的敏感性；其他等。
二、现代分类鉴定方法
（一）微生物遗传型的鉴定
1、DNA碱基比例测定
2、核酸分子杂交法
3、165rRNA寡核苷酸编目分析。
（二）细胞化学成分的鉴定
1、细胞壁的化学组分
2、全细胞水解液的糖型
3、磷酸类脂成分分析
4、枝菌酸
5、醌类分析
6、气相色谱技术的应用
（三）数值分类法（taxonometrics）
三、鉴定微生物专用仪器与设备
