若要了解微生态学，首先要了解一点微生物学的常识。

    顾名思义，微生物是与宏生物（人类、动物、植物）相对而言的微小生物。如细菌、霉菌、病毒等，它们微小得人用肉眼直接观察难见其踪影，必须借助光学显微镜甚至电子显微镜将其放大成百上千倍乃至上万倍才能见其真面目。微生物虽小，却具有适应性强，吸收营养迅速，繁殖快，数量多，分布广等特点。要说繁殖之快，有的细菌只要条件适宜，可以20分钟繁殖一代；要说繁殖之广，在自然界中几乎可以说是无处不在，无时不有，上到85000米以内的天空中，下到1000～2000米的土层里和11000米的海底都可以觅到微生物的踪迹；要说数量之多，微生物至少有50多万种，一克土壤中可有100亿个细菌和真菌，每毫升海水中可有870万～1200万个细菌，人或动物一克粪便中细菌数可达1000亿个。微生物不仅分布在自然环境中，在人类、动物、植物的表面及人类、动物机体与外界相通的呼吸道、消化道等腔道内也有多种微生物的栖生。如人的肠道内就栖居着上百万亿个细菌。

    根据微生物的特性，微生物分为细菌、病毒。衣原体、立克次体、支原体、螺旋体、放线菌、真菌等若干类。像痢疾是细菌引起的，流行性感冒、病毒性肝炎、麻疹是病毒引起的，病毒是螺旋体感染的，沙眼是衣原体感染的。2003年肆虐一时的非典型肺炎，罪魁祸首就是SARS病毒。在第一次世界大战时，随着士兵与难民的大规模流动，霍乱、鼠疫、天花、流感、伤寒、回归热等烈性传染病席卷全球，夺走了亿万人的生命。医学科学家们陆续发现了一个又一个病原微生物，于是人们逐渐地形成了一种比较普遍的观点，认为“微生物主要是有害的”。其实，微生物当中绝大多数对人类和动植物的生存是必需和有益的。如果世界上没有微生物，人类、动物、植物也将无法生存。如人与动物的粪便在土壤中经微生物的作用，分解出大量的氮类等物质供植物生长发育，而植物又为人类和动物所利用。我们日常生活中处处可见微生物的作用，像酒、酱、酱油、醋的发酵制作，馒头、面包的制作，酸菜、泡菜的淹渍等举不胜举。

    特别是微生态学的建立，使人们逐渐认识到人体寄生的微生物对人体的有益作用。发现正常微生物群对其宿主（人类、动物、植物）在正常的条件下是无害的，且其多数或在主要方面对人类是有益的，它们与其宿主在其微环境保持着生态平衡。人体内的微生物只有在外界环境、疾病等因素的影响下，微生态失调，一些微生物才有致病性。