什么是生物信息学:生物信息学(Bioinformatics)是80年代末随着人类基因组计划的启动而兴起的一门新的交叉学科,最初常被称为基因组信息学。美国每年都要拨出相当大的经费支持生物信息学的发展。日本的经济近年来虽然不甚景气,但发展科学技术的雄心却不见减弱,1998年用于发展基因组生物信息学技术的经费是1997年的533%。
广义地说,生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈现指数增长的生物学数据的一门学科。首先是研究遗传物质的载体DNA及其编码的大分子蛋白质,以计算机为其主要工具,发展各种软件,对逐日增长的浩如烟海的DNA和蛋白质的序列和结构进行收集、整理、储存、发布、提取、加工、分析和研究,目的在于通过这样的分析逐步认识生命的起源、进化、遗传和发育的本质,破译隐藏在DNA序列中的遗传语言,揭示人体生理和病理过程的分子基础,为人类疾病的预测、诊断、预防和治疗提供最合理和有效的方法或途径。生物信息学已经成为生动医学、农学、遗传学、细胞生物学等学科发展的强大推动力量,也是药物设计、环境监测的重要组成部分。
生物信息学是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白组学(Proteomics)两方面,具体说,是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构与功能的生物信息。目前基因组学的研究出现了几个重心的转移:一是将已知基因的序列与功能联系在一起的功能基因组学研究。二是从作图为基础的基因分离转向以序列为基础的基因分离。三是从研究疾病的起因转向探索发病机理。四是从疾病诊断转向疾病易感性研究。生物芯片(Biochip)的应用将为上述研究提供最基本和必要的信息及依据,将成为基因组信息学研究的主要技术支撑。生物信息学的发展为生命科学的进一步突破及药物研制过程革命性的变革提供了契机。就人类基因组来说,得到序列仅仅是第一步,后一步的工作是所谓后基因组时代 (post-genome era) 的任务,即收集、整理、检索和分析序列中表达的蛋白质结构与功能的信息,找出规律。生物信息学将在其中扮演至关重要的角色。
二、生物信息学的研究范围
大致可分三类:
(1)数据库的建立与优化。国际上著名的公共数据库有genebank、swissport、PIR、PDB,另外一些公司还有内部数据库。
(2)培养生物信息学专业人员。
(3)数据库的理论研究、软件的研制、序列的排列比较(alignment)、对新序列的识别与预测等。
三、意义及现状
生物信息学的发展将会对生命科学带来革命性的变革。它的成果不仅对相关基础学科起巨大的推动作用,而且还将对医药、卫生、食品、农业等产业产生巨大的影响,甚至引发新的产业革命。
因此,各国政府和工业界对此极为重视,投入了大量资金。欧美各国及日本相继成立了生物信息数据中心,如美国的国家生物技术信息中心、国家基因组资源中心、英国的欧洲生物信息研究所、日本的国家遗传学研究所等。以西欧各国为主的欧洲分子生物学网络组织(European Molecular Biology Network, EMBNet),是目前国际最大的分子生物信息研究、开发和服务机构,通过计算机网络使英、德、法、瑞士等国生物信息资源实现共享。
