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小鼠β-actin基因的克隆表达
作者:佚名 来源:生物秀 时间:2008-7-28
    1. 动物组织RNA的提取

    实验目的:掌握由动物组织中提取总RNA的方法

    实验原理:Trizol试剂是一个包含酚、异硫氰酸胍和SDS的单相酸性溶液,其在裂解细胞的同时抑制RNase的活性,随后加入氯仿,酚会大量的溶解在氯仿中。由于DNARNA在酸性酚中的溶解性不同,造成DNA分布在下层的氯仿酚溶液中,RNA则分布在上层的水相中,最后用异丙醇沉淀水相中的RNA,并用70%乙醇洗涤沉淀,这样就可以得到比较纯净的总RNA.

    实验步骤:

      先在研钵中加入液氮,再将组织剪成块在液氮中磨成粉末,用液氮预冷的药匙取50100mg组织粉末加入已盛有1mlTrizol液的EP管中(注意组织粉末总体积不能超过所用Trizol体积的10%),充分混合均匀。

      室温放置5min,然后加入200µl的氯仿,盖紧EP管并剧烈摇荡15秒钟。

      12000rpm离心10min,取上层水相于一新的EP管中(千万不要将中间的沉淀层和下层液混入,否则重新离心分离),加入500µl异丙醇,温和颠倒混匀。室温放置10min12000rpm离心10min

      小心地弃去上清液,加入1ml75%乙醇,涡旋混匀,4℃下12000rpm离心5min。重复操作一次。

      弃去上清液(尽量将残余液体除去),室温或真空干燥510min(注意不要干燥过分,否则会降低RNA的溶解度)。用30µl DEPC处理过的水将RNA溶解,必要时可55℃~60℃水浴 10minRNA可进行mRNA分离,或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。

       另外,还可以通过试剂盒提取总RNA 操作步骤见试剂盒说明。

    1. RT-PCR扩增目的基因及琼脂糖电泳分析

    实验目的:掌握通过RT-PCR方法由真核生物的总RNA中获得目的基因的方法,并通过琼脂糖电泳对扩增结果进行定性检测。

    实验原理:由于真核生物的mRNA3′端存在 Poly(A)尾,这样以oligdT)为引物,在逆转录酶的催化下,就可以合成互补DNAcDNA),然后以cDNA为模板,利用目的基因扩增引物进行PCR就可以扩增出目的基因。

    实验步骤:

    RNA的反转录

     EP管中依次加入

           RNA模板                 3 μl

           OligdT18引物          1μL

           DEPC H2O                8 μL

       混合后,70℃水浴5 min(破坏二级结构),再冰浴5min

     在管中依次加入 (反应体系为20 μL)

           RT 5×buffer             4μL

           RNasin             1μL

           dNTP ( 10mM)           2μL

        混匀,37℃ 5min

           M-MULV反转录酶      1 μL

        置于 42℃水浴,1h

     ③ 70℃保温5min(使酶失活)。

     -20℃保存备用。

    PCR扩增目的基因

       以反转录产物为模板,克隆引物B1B2为引物,利用rTaq酶进行扩增目的基因,用于后续连入克隆载体的操作,然后再以表达引物EB1EB2为引物,利用Pfu DNA聚合酶进行扩增目的基因,用于后续连入表达载体的操作。

                         94 ℃         3 min 
     

                            94 ℃         45Sec

             30 cycles:       57 ℃         45Sec

                            72 ℃         45Sec

                            72 ℃         5min

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