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DNA重组技术(Recombinant DNA)
作者:佚名 来源:医学遗传学实验手册 时间:2008-5-22

    2.质粒DNA的小量制备
    常见的质粒DNA提取方法有简易一步提取法、碱裂解法和煮沸法。本实验采用的是碱裂解法,碱裂解法的原理:在PH 12.0~12.6碱性环境中,线性的大分子量细菌染色体DNA变性,而共价闭环质粒(CC)DNA仍为自然状态。将pH调至中性并有高盐浓度存在的条件下,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构。大部分染色体DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍为可溶状态。通过离心,将可去除大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,再用乙醇沉淀回收质粒DNA。
    3.质粒DNA的限制性内切核酸酶(限制酶)切分析
    限制酶存在于原核生物体内,根据其结构和功能特性分为:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型。Ⅰ型切点不固定,Ⅲ型其切割位点在识别位点之外,只有Ⅱ型其特异性切点位置可以控制和预测,可以产生固定的DNA片段,基因工程中所用的限制酶均为Ⅱ型限制酶。这类酶的特点是具有能够识别双链DNA分子上的特异性核苷酸序列的能力,能在这个特异性核苷酸序列内切断DNA双链,形成一定长度和顺序的DNA片段。选择合适的限制酶对重组的环状质粒进行酶切,将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,用已知相对分子量的线状DNA(DNA分子量标志)及未经酶切的重组环状质粒为对照,可以对重组环状质粒中的目的DNA分子进行初步鉴定。

    【实验用品】
    1.PCR扩增仪;恒温振荡培养箱;超净工作台;细菌恒温培养箱;台式高速离心机;电热恒温水浴箱;冰箱;电泳仪; 电泳槽,样品槽模板(梳子);紫外灯;保鲜膜;一次性塑料手套;凝胶自动成像仪。
    2.三角烧瓶(500ml, 250ml,100ml),培养皿,玻璃试管,试管塞,玻璃棒,酒精灯,镊子,脱脂棉,纱布,乙醇,容器盒。
    3.微量加样器(1000μl,200μl,20μl);Tip头(1000μl,200μl,20μl)。Tip头盒(1000μl,200μl,20μl);Eppendorff管(2ml,1.5ml,0.5ml),Eppendorff管架。Parafilm,透明胶带。
    4.DNA重组相关试剂:
    1)Taq DNA聚合酶,缓冲液,dNTP,特异性引物,靶DNA;凝胶回收试剂盒;TA克隆载体:pMD18-T;感受态细菌;氨苄青霉素(100mg/ml)。
    2) LB培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化钠10g,10N NaOH调pH至7.0定容至1L。15磅高压消毒,4℃保存。
    3)LB琼脂培养基:15g琼脂粉溶于1000ml LB培养基,15磅高压消毒备用。
    5.质粒提取试剂:
    溶液Ⅰ(10×):0.5M葡萄糖;0.25M Tris-Cl (pH8.0);0.1M EDTA,10磅高压消毒,4℃保存备用.
    溶液Ⅱ:0.2N NaOH;1%SDS 室温贮存,即用即配。
    溶液Ⅲ:3M NaOAc(pH4.8) 10磅高压消毒,室温贮存。
    RNA酶 A: 10mg/ml
    TE缓冲液:10mM Tris-Cl (pH7.6),1mM EDTA(pH8.0)
    6.质粒DNA的限制性内切酶酶切及琼脂糖凝胶电泳相关试剂:
      限制性内切酶Hind Ⅲ、XbalⅠ及酶反应所需缓冲液;琼脂糖;溴化乙啶贮存液(10mg/ml);6×载样缓冲液。
      Tris-乙酸(TAE)贮存液:
     50×:242克Tris碱,57.1ml冰乙酸,100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
           加水至1L

    【实验步骤】
    1.PCR产物纯化
    PCR产物经琼脂糖凝胶电泳,应用凝胶回收试剂盒回收纯化目的DNA片段。

    2.目的DNA片段连接至T/A克隆载体 即重组DNA分子的构建
    反应体系及条件如下:

     
    图2.3  pMD18-T载体

     

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