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质粒DNA的提取、酶切与鉴定
作者:陈红漫 来源:生物秀 时间:2008-5-21

    (4)向上清液中加入等体积酚/氯仿,震荡混匀,10 000r/min 离心2 min,将上清液转移至新的离心管中。
    (5)向上清液中加入等体积无水乙醇,混匀,室温放置2 min。离心5 min,倒去上清乙醇溶液,将离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。
    (6)加1mL 70%乙醇,震荡并离心,倒去上清液,真空抽干,待用。
    3.质粒DNA 的酶解
    将自提质粒加入20μL 的 TE 缓冲液,使 DNA 完全溶解。取清洁、干燥、灭菌的具塞离心管编号用微量加样器按表1 所示将各种试剂分别加入每个小离心管内。
    表1 DNA酶切加样表

    * 补无菌双蒸水至20μL,依实际情况做相应调整
    加样后,小心混匀,置于37℃水浴中,酶解2~3h,反应终止后,各酶切样品于冰箱中贮存备用。
    4.DNA 琼脂糖凝胶电泳
    (1)琼脂糖凝胶的制备:称取0.6g 琼脂糖,置于三角瓶中,加入50 mL TBE 缓冲液,经沸水浴加热全部融化后,取出摇匀,此为1.2%的琼脂糖凝胶。
    (2)胶板的制备:取橡皮膏(宽约1cm)将有机玻璃板的边缘封好,水平放置,将样品槽板垂直立在玻璃板表面。将冷却至65℃左右的琼脂糖凝胶液,小心倒入凝胶液,使胶液缓慢展开,直到在整个玻璃板表面形成均匀的胶层,室温下静置30 min,待凝固完全后,轻轻拔出样品槽模板,在胶板上即形成相互隔开的样品槽。用滴管将样品槽内注满TBE缓冲液以防止干裂,制备好胶板后立即取下橡皮膏,将胶板放在电泳槽中使用。
    (3)加样:用微量加样器将上述样品分别加入胶板的样品小槽内。每次加完一个样品,要用蒸馏水反复洗净微量加样器,以防止相互污染。
    5. 电泳
    加完样品后的凝胶板,立即通电。样品进胶前,应使电流控制在20mA,样品进胶后电压控制在60~80V,电流为40~50 mA。当指示前沿移动至距离胶板1~2cm 处,停止电泳。
    6. 染色
    将电泳后的胶板在EB 染色液中进行染色以观察在琼脂糖凝胶中的DNA 条带。
    五、结果与观察
    在波长为254nm 的紫外灯下,观察染色后的电泳胶板。DNA 存在处显示出红色的荧光条带。
    六、思考题
    1.染色体DNA 与质粒DNA 分离的主要依据是什么?
    2.EB 染料有哪些特点?在使用时应注意些什么?
    参考答案
    1. 纯化DNA的方法主要依据染色体DNA比质粒DNA分子大得多,而且染色体DNA被断裂成线状分子,但质粒DNA 为共价闭环结构,当加热或用酸、碱处理DNA 溶液时,线状染色体DNA 容易发生变性,共价闭环的质粒DNA 在冷却和回到中性pH 时即恢复其天然构象。
    2.EB 染料的全名是3,8-二氨基-5-乙基-6 苯基菲啶溴盐。EB 能插入DNA 分子中碱基对之间,导致EB 与DNA 结合,DNA 所吸收的260nm 的紫外光传递给EB,或者结合的EB 本身在300nm 和360nm 吸收的射线均在可见光谱的红橙区,以560 nm 波长发射出来。EB 染料有许多优点,如染色操作简便、快速,室温下染色15~20min;不会使核酸断裂;灵敏度高,10ng 或更少的DNA 即可检出。
    但应特别注意的是,EB 是诱变剂,配制和使用EB 染色液时,应带乳胶手套或一次性手套,并且不要将该染色液洒在桌面或地面上,凡是沾污EB 的器皿或物品,必须经专门处理后,才能进行清洗或弃去。

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