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检测鼠肝肌动蛋白(p—acdn)基因
作者:赵涵芳 张怡平… 来源:上海交大 时间:2007-3-24

    (一)  鼠肝DNA的制备

    原理
        DNA是储存遗传信息的物质,是遗传的物质基础,它与生命的正常活动如种厉遗传、生长发育有密切关系。其结构与功能的研究是当前分子生物学研究的主要内容之一。
    核酸广泛存在于生物中,DNA含有生物体的全部遗传信息,在生物组织中以核蛋白(DNP)形式存在。真核生物中,DNA主要存在于细胞核中,核外也有少量,如线粒体DNA,称为核外基因。DNA的分子长度一般随生物由低级进化到高级而增加。人类基因组含2.9×109bp。
    无论是研究核酸的结构,还是它的功能,首先需要对核酸进行分离与提纯。分离与提纯核酸最基本的要求是保持核酸的完整性及纯度。
        要从生物组织中提取DNA,睱DNA是以核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中故首先必须粉碎组织,裂解细胞膜和核膜,使DNP释放出来,再用苯酚提取蛋白。由于细胞中的核糖核蛋白(RNP)和DNP往往一起被提取,故DNA沉淀中混有RNA。需用核糖核酸酶(RNase)处理,去除RNA。并用蛋白酶将遗留的少量蛋白质水解除去,再经苯酚处理,乙醇沉淀,最后可得较为纯净的DNA。它的纯度可以从260nm波长处的光密度和280nm波长处的光密度之比值测知,一般以O.D260nm/O.D280nm能达到1.8左右为标准。
        分离与提纯过程中保持DNA的完整性和纯度存在许多困难,主要原因有:
        (1)细胞内存在很高的DNA酶活性,在分离与提纯过程中会造成核酸的降解。    ,
        (2)DNA分子很大,分离过程中因化学因素或物理因素使DNA降解,如强酸、强碱、温度过高或机械张力剪切等。DNA的定量可采用化学的定磷法、定核酸法。目前多数实验室采用紫外分光光度法测定核酸含量,以下公式可作为紫外定量时参考:双链DNA含量:
        O.D260nm×样品稀释倍数×50ug/ml=  ug/m1样品。
    器材   
    1.塑料离心管:6
    2.刻度离心管:1
    3. 滴管:
          长:             1 吸酚:氯仿混合液
          中:             1 吸乙醇
          短(钝口) : 1吸DNA水溶液
    4.细玻棒:1
    5.移液管:1
    6.微量取样器1
    7.手套:1副
    8.离心机
    9.紫外分光光度计
    10.37℃水浴,50℃水浴
    11.组织捣碎器
    12.电泳仪及电泳槽
    试剂
    1.裂解缓冲液:
    50mmol/l    Tris—Hcl pH7.4
    20mmol/lEDTA、
    0.5%SDS
    100mmol/l NaCl
    配法:
    1mol/l    Tris—HCl    pH7.4  50ml
    20%SDS    25ml
    2mol/l NaCl    50ml
    0.5mol/l EDTA    40ml
    蒸馏水稀释至    1000ml
        其中Tris—HclpH7.4维持PH恒定,防止DNA变性和水解。EDTA能络合二价金属离子,当Mg+’被络合后,细胞内释放出来的DNA酶的作用被抑制,以避免DNA的降解,同时金属离于络合后,细胞膜的稳定性下降,有利于膜的裂解;SDS有使蛋白质变性的作用,它能破坏膜蛋白的构象,因此使膜裂解,它又能使核蛋白中的核酸与蛋白质解离,并且SDS也具有抑制DNA酶的作用。
    2.苯酚
        重蒸苯酚加入抗氧化剂8—羟喹啉1mg/ml,用1mol/l PH8.0 Tris—HCl洗一次,再用0.1mol/1Tris—Hcl PH8.0洗二次,苯酚PH在7.6—7.8之间。
    3.苯酚:氯仿混和液(1:1)
        苯酚加上等体积氯仿并用水饱和,混和液分层,上层为水相,下层为有机相且带黄色。
        苯酚和气仿都是蛋白质变性剂,苯酚使蛋白质变性的作用强于氯仿,伹氯仿具有较好的
    分层作用。
    4.无水乙醇
        DNA在PH7.4条件下分于带负电,在NaCl存在条件下,DNA盐呈电中性,乙醇将DNA分子周围的水分夺去,DNA失水形成白色絮状沉淀。
    5.TE缓冲液
    50mmol/l  Tris—HCl   pH7.0
    5mmol/l   EDTA
    配法:
    lmol/l    Tris—HCl     pH7.4   10ml
    0.5mol/l EDTA    EDTA
    蒸馏水稀释至    1000ml
    6.RNase      10mg/ml

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