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Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法
作者:未知 来源:丁香园 时间:2007-2-6
    模板的处理:

    1.平板上的菌落长到肉眼可见时(约12小时);

    2.将除了模板之外的其它PCR反应液的组分准备好,并分装。引物最好使用Kit中已有的检测专用的引物,或者一条使用载体上的引物,一条使用基因的特异性引物(这样做可以鉴定非定向克隆的方向);

    3.用半根灭菌的牙签(节约,而且好用)挑取菌落,在PCR管中涮以下,放入一个灭菌的1.5毫升离心管,对PCR管和1.5毫升离心管编号;

    4.PCR扩增,1% 琼脂糖凝胶电泳;

    5.对于PCR扩增显现特异性条带的克隆,把置于1.5毫升离心管中的半截牙签扔到5毫升YPDZ培养基中,30度培养,8-12小时后提质粒,酶切鉴定确认。 

    PCR反应体系:
    以TaKaRa Taq DNA聚合酶反应为例,引物为5´ AOX1 primer,3´AOX primer:
    组分  20μl体系
    10xReaction Buffer  2.0μl
    dNTP  1.6μl
    Primer 1(20pmol/L)  0.5μl
    Primer 2(20pmol/L)  0.5μl
    ddH2O  15.2μl
    Taq DNA聚合酶  0.2μl
    TOTAL  20.0μl

    3.5.3 PCR反应条件:
    初始变性  94℃ 4min  1
    变性  94℃ 30s  30个循环
    退火  50~54℃ 30s  
    延伸  72℃ 30s  
    结束延伸  72℃ 10min  1
    保存  4℃  1

    如果筛选的是Mut+,将会出现两条带,一个是目的基因,另一个是2.2kb的AOX1基因,空质粒会出现以下条带(pPICZαA 588 bp),将两者的大小加在一起来解释出现的实验结果。
    我的结果是空载体的有大约580多的条带,但重组子的PCR只有将近1000bp的条带(我的目的基因是400bp),没有2.2kb的条带。
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