TaqMan探针 评价
优点：荧光信号强
与其它探针相比设计简单
可用于多通道检测
可用于SNP的检测
缺点：比DNA结合染料价格高
Ct value and Real-Time Quantitative PCR Theory
Ct值
（Threshold Cycle）
PCR扩增过程中，扩增产物荧光信号超过基线值（进入指数增长期）时的循环数。
一般而言，荧光扩增曲线扩增曲线可以分成三个阶段：荧光背景信号阶段 , 荧光信号指数扩增阶段和平台期。在荧光背景信号阶段，扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖，我们无法判断产物量的变化。而在平台期，扩增产物已不再呈指数级的增加。 PCR 的终产物量与起始模板量之间没有线性关系，所以根据最终的 PCR 产物量不能计算出起始 DNA 拷贝数。只有在荧光信号指数扩增阶段， PCR 产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系，我们可以选择在这个阶段进行定量分析。
为了定量和比较的方便，在实时荧光定量 PCR 技术中引入了两个非常重要的概念：荧光阈值和 CT 值。荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上，但一般我们将荧光域值的缺省设置是 3-15 个循环的荧光信号的标准偏差的 10 倍。每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称为 CT 值。
This slide illustrates that there is a large difference in the end-point values of identical reactions. This is a uniformity experiment in which 5mL of a reaction was made and then 50 uL from this reaction mix was pipeted into each well. The end-point values range from ~450-750 rfu, however the region indicated is very reproducible.
[Be prepared to explain why these values may vary, from previous slide: can be due to enzyme exhaustion, reactants - dNTPs, Mg2+ , primers - limiting, too much DNA being made which interferes with other new synthesis] Notice that the plateau phase has started when end point values are reached
