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甲基化检测方法(亚硫酸氢盐修饰后测序法)
作者:春雨濛濛 来源:丁香园 时间:2007-9-9

    第五部分 PCR产物的凝胶回收
    这一步比较简单,可以购买一个凝胶PCR产物回收试剂盒,国产的就很好、价格也合理,比如TIANGEN的产品(用过)。把切下来的胶按说明书操作即可。
    几个细节:
    1:PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,要使用新配的电泳液。凝胶浓度1%-2%均可。
    2:凝胶DNA回收时在300nm紫外灯下观察条带位置,切取目的片断所在位置的凝胶,尽量小,保证特异性。
    3:紫外照射时间不能过长,否则对DNA有损伤。
    4:回收后的DNA如不马上用就储存于-20度,在数月内是很稳定的。

    第六部分 PCR产物与T载体的连接和转化、蓝白斑筛选
    1:连接T载体(本实验使用的是Promega的试剂盒)
    15ul体系
    T-easy 1ul
    Ligase 1ul
    2xbuffer 7.5ul
    DNA 5.5ul
    4度,过夜。  
    2:连接产物的转化
    1)-70度冰箱内取出感受态细菌,融化后置于冰上;
    2)连接产物15ul 全部加入,至于冰上30分钟;
    3)42度, 90秒钟;
    4)冰上2分钟;
    5)800ul LB培养基;
    6)280rpm,37度,摇床45分钟(将管放水平了摇,保证菌液摇匀);
    7)8000rpm,1分钟;在超净台内去上清,留100-150ul;
    8)涂板:37度孵箱过夜;(板为含有氨苄青霉素的固体LB培养基)
    先涂:X-gar 35ul
    IPTG 25ul
    后涂:混悬液
    过夜后可见板上长出很多蓝色或白色斑点,取白色斑点,尤其是蓝色斑点周围的白色斑点,此处自联率较低。
    3:取白斑,划种于新板上
    新板:先涂:X-gar 35ul
    IPTG 25ul
    然后于板底划出分区,进行标记。根据需要,一般一板作50个克隆没有问题。
    针头挑白斑划2道于板上相应区域内。
    37度,孵箱过夜。
    4:联系测序公司送测序。一般一个克隆在35-45元。

    这一部分的细节:
    1:涂板要均匀,保证Xgar和IPTG均匀分布在板面上;
    2:不要让蓝白斑长得太满,否则选取克隆时容易一下挑2个。

    以上是我实验的全部过程,终于写完了和大家分享,希望对大家有帮助。如有疑问,敬请提出,以便交流。并请不吝斧正

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