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使用prime 5.0验证引物的方法
作者:未知 来源:生物秀 时间:2007-9-9

    我们做实验室有时会用到别人已经用过的引物,但如何才能知道这个引物是否正确呢?我通常利用prime 5.0来验证引物。
    下面我用常用的内参G3PDH将验证过程介绍如下:
    G3PDH的引物序列来自一片外文文献:
    上游:AATGCATCCTGCACCACCAA
    下游:GTAGCCATATTCATTGTCATA
    所得片断为516bps。
    首先在pubmedline中查到G3PDH的mRNA序列,如图

     然后打开primer 5.0,点file→new→DNA sequence,将上面的mRNA序列复制到new sequence 框内,注意选择as is:

     

    先加上游引物,点Primer→s→edit primers, 将上游引物复制到引物区,注意选择as is。点analyze→prime,可见下图,引物与反义链匹配。

     

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