在Oligo中能够产生许多任何长度的寡核苷酸数据库。它能够用来:
①、分析引物效率,
②、检查能否形成二聚体来判断能否用于多重引物,
③、对寡核苷酸进行分类。
④、将寡核苷酸序列直接通过e-mail或fax与传给你的引物合成公司,
该数据库主要包括一下内容:
(1)ID Number:ID number是自动产生的。包括:
A、accession number:X52330
B、L或U前面的数字:代表引物的第一个核苷酸在分析的序列的位置:779
C、L代表负链引物,U代表正链引物
D、L或U后面的数字:代表引物的长度。
(2)3' dim. △G:
①引物3'末端形成二聚体的自有能。如果是多重引物时,该值指的是任意的多重引物之间形成的最强的二聚体(if you multiplex using this window, this value refers to the strongest dimer formed with any of the multiplexed primers,不知道翻译对不对)
②字母的意义:
M:该引物是一种多重引物(与所有的M型引物、C型引物相容)
C:该引物与其它M型引物相容。
D:该引物形成自身二聚体。解决办法:改变严谨度
NC:该引物与自身相容,但与该数据库中至少一种M型引物不相容。
(3)P.E.:即priming efficiency numbers。
354/441的第一个数字代表使用者搜索范围内真正的数值,第二个数字代表最大值(没有错配)
11. File - Database / Order Form



