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Oligo 6 Tour 主要功能介绍
作者:依医 来源:yiyuanboke 时间:2007-9-6

    在Oligo中能够产生许多任何长度的寡核苷酸数据库。它能够用来:
    ①、分析引物效率,
    ②、检查能否形成二聚体来判断能否用于多重引物,
    ③、对寡核苷酸进行分类。
    ④、将寡核苷酸序列直接通过e-mail或fax与传给你的引物合成公司,
    该数据库主要包括一下内容:
    (1)ID Number:ID number是自动产生的。包括:
    A、accession number:X52330
    B、L或U前面的数字:代表引物的第一个核苷酸在分析的序列的位置:779
    C、L代表负链引物,U代表正链引物
    D、L或U后面的数字:代表引物的长度。
    (2)3' dim. △G:
    ①引物3'末端形成二聚体的自有能。如果是多重引物时,该值指的是任意的多重引物之间形成的最强的二聚体(if you multiplex using this window, this value refers to the strongest dimer formed with any of the multiplexed primers,不知道翻译对不对)
    ②字母的意义:
    M:该引物是一种多重引物(与所有的M型引物、C型引物相容)
    C:该引物与其它M型引物相容。
    D:该引物形成自身二聚体。解决办法:改变严谨度
    NC:该引物与自身相容,但与该数据库中至少一种M型引物不相容。
    (3)P.E.:即priming efficiency numbers。
       354/441的第一个数字代表使用者搜索范围内真正的数值,第二个数字代表最大值(没有错配)

    11. File - Database / Order Form

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