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RNAi起源与专有名词
作者:未知 来源:生物秀 时间:2007-8-6


    14.gene silence:基因沉默

    研究结果发现有大量的转基因植株不能正常表达,通常这并不是由于转基因的缺失或突变引起的,而是基因失活的结果.这种失活的现象称为基因沉默。

    15.RNA transfection:RNA转染。

    16.Sense RNA:正义链RNA

    17.Antisense RNA:反义链RNA。

    18.19+2+2 nt siRNA:

    在细胞中双链RNA一般都被切割成21-23小片段,这样的RNA片段能达到更好的RNAi作用。人工合成的siRNA也是依据这个原理,所合成的RNA就是19nt的碱基序列再加上两端的识别序列如-GG,-TT等。19.SECs:(siRNA expression cassettes)siRNA表达框架一种由PCR得到的siRNA表达模版,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。20.Homologies:同源性指同种类不同个体或者不同种类个体之间的,染色体或者蛋白质序列的相似性

    21.Homologous Chromosome:同源染色体一对染色体,分别来自父本和母本,染色体上有着相同的线性基因序列。

    22.Recombinant Clone:重组克隆将不同来源的DNA片段合成在一个DNA分子中,这种技术称为重组,得到的分子为重组克隆

    23.Ribonucleic acid:核糖核酸RNA从细胞的细胞核和细胞质部分分离出来的化学物质。在蛋白质合成和其他生化反应中起着重要作用,RNA的结构和DNA的结构类似,都是有核苷酸按照一定顺序排列成的长链。RNA可以分为信使RNA、转运RNA、核糖体RNA以及其他类型的RNA。

    24.rRNA:(RNARibonsomal RNA,核糖体)存在于核糖体中的RNA。25.Ribonsome:核糖体细胞质中含有rRNA和相关蛋白质的细胞器,是蛋白质的合成场所。26.Transformation:转化将外源DNA整合到某一细胞基因组中的过程。

    27.Entrez:

    美国国家生物技术信息中心所提供的在线资源检索器。该资源将GenBank序列与其原始文献出处链接在一起。

    28.NCBI:(National Center for Biotechnology Information)美国国立生物技术信息中心

    为美国国家医学图书馆(NLM)和国家健康协会(NIH)下属部门之一,1988年设立。主要提供生物医学领域的信息学服务,如世界三大核酸数据库之一的GenBank数据库,PubMed医学文献检索数据库等。

    29.GenBank:NIH的基因序列数据库是所有公开的DNA序列的集合 ( Nucleic Acids Research 1998 Jan 1;26(1):1-7). 截至1998年12月,GenBank大约收集了 2,162,000,000 个碱基、3,044,000 个序列。

    30.Ribosomal RNA:(核糖体RNA,简写为rRNA)

    是一组存在于核糖体中的RNA分子。31.UniGene:美国国家生物技术信息中心提供的公用数据库,该数据库将GenBank中属于同一条基因的所有片断拼接成完整的基因进行收录。32.BLAST:(Basic Local Alignment Search Tool)基本的基于局部对准的搜索工具一种快速查找与给定序列具有连续相同片断的序列的技术。是一个序列比对Alignment应用程序。它可以在线选择服务器上的数据库进行序列比较包括DNA/DNARNA/DNA蛋白/蛋白序列比对序列比对的作用很多如同源核酸或蛋白序列的查找引物或探针特异性分析物种进化树的构建等等目前多数网站和软件均提供免费的BLAST的本地或在线检索比较著名的提供序列比对服务有NCBI的BLAST检索如果需要详细了解这个程序可到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/去具体看一看帮助文件但是上NCBI需要国际代理国内的朋友可通过上海生科院的生物信息中心进行BLAST网址http://bioinfo.biosino.org:8888/blast/ 速度不错33.RT-PCR:逆转录PCRRT-PCR是以RNA为起始材料经逆转录反应产生cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获取目的基因或检测基因表达。

    34.DNA印迹杂交:(DNA blot hybridization)有两种核酸印迹法:

    ·将DNA或RNA溶液直接点样于硝酸纤维素膜或尼农膜上(斑点或狭线印迹)
    ·经琼脂糖凝胶电泳将片段的DNA或RNA转移到膜上(Southern和Northern印迹法)。DNA在电泳前先用限制性内切酶消化。

    35.RNA印迹杂交:(RNA blot hybridization)

    RNA印迹杂交是一种检测已固定在滤膜上的总RNA或mRNA特定靶序列的技术。

    36.RNA酶控制:

    在实验中前期的质粒的构建和提取是要用到RNAse A这种酶的存在会降解后期要转录生产的RNA 如果前期出现了这个酶的污染就会导致后期实验的失败,而后期转录是又要用到其他的RNA酶,如RNA 聚合酶3等,因此在实验中严格控制好RNA酶是RNA实验的关键,具体的做法是做到DNA,RNA移液器的专用,DNA实验室和RNA实验室的物品和器械分开使用,将实验室中的任务污染源减少至最低。

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