提供靶细胞特殊性的两种主要方法继续进行。首先，SU蛋白的天然束缚受体区域曾被配体或认识特殊细胞表面受体的单链抗体所代替，曾靶向范围广泛的收体。但是困难在于，即使在工程化载体和靶细胞受体之间能获得特殊束缚，在实验中的基因转化仍很低。理由是清楚的，想象逆转录病毒包封蛋白将变成了具有络合四元结构的三聚体。当天然束缚区域被外来序列取代时，整个包封蛋白的结构发生变化，结果产生新的蛋白构象，这种改变导致了不能发生病毒和细胞膜之间的融合，没有融合就不能发生有效的核进入和基因转化。

在创建US的束缚受体区域的同时，为执行核进入而保持包封蛋白的能力将需要更好地掌握包封络合蛋白中的结构—功能关系。这种认识随着最近发表的有关鼠亲病毒SU蛋白束缚受体区域的三维结构而获得进展。工程化配体嵌进具有为核进入而保持包封蛋白功能性高机率的SU蛋白中的各个特殊位置，目前成为可能。

逆转录病毒包封蛋白的另一个结构—功能研究也有助于我们理解在束缚后如何获得高效的核进入。去年发表了Moloney亲病毒逆转录病毒TM蛋白的部分三维结构。最近在预见包封蛋白的三聚结构中，已显示出它的分离单体能彼此交联。换句话说，每个有缺陷的分离单体，彼此能互补以便提供一种活性三聚体包封。运用这种工艺有可能去定义TM蛋白中的分离功能区域。当使完成包封蛋白三维结构和功能区域变成可知时，具有高效靶特性细胞的结构逆转病毒载体有可能产生。

运用第二种主要的称之为“链”（tethering）靶方法曾获得进展。虽然曾设计了几种创造性系统，但目前最成功的方法是将认识细胞外基质（ECM）成份的配体嵌进不能扰乱天然束缚受体区域的部分SU蛋白中。链（tethering）浓缩靶细胞附近ECM中的载体。然后束缚受体和核进入通过天然包封—受体机理产生。出现特别用于基质的两种配体是特性溶胶、纤维结合素。纤维结合素是存在于正常的ECM中，暴露的溶胶存在于危险区域，例如，血管成形术后心血管系统伤口损伤处。

非分离细胞的传导。 虽然基于MULV的逆转录病毒载体不能去传导非分离细胞这点在某些状态非常有用，例如，当毒素基因被嵌进分离癌细胞并不会进入正常的非分离细胞（见下面的“临床试验”），在许多状态中，有一种要求即把一种治疗基因嵌进正常的非分离细胞中。许多潜在的靶细胞不会激活分离活体；只有某些血细胞（而不是干细胞）和细胞衬里胃肠束继续分离。慢病毒（例HIV—1）能够感染非分离细胞，因为再结合能产生致病原病毒的可能性而使这些病毒来的载体结构超过安全范围。企图转化至鼠逆转录病毒，结果从允许传导非分离细胞HIV来的特殊信号没有获得成功。最近，有可能在逆转录病毒中使用刚好22%的HIV基因组（不包含任何引起病源体的基因）。由于使用了非—HIV外膜蛋白而进一步减少了再结合的机会。杂交系统（hybrid system）以同样的方式为提供体内传导非分离细胞的选择负有重大责任。另一种正在开发的RNA病毒是根据人类泡沫病毒来开发的。这些载体能传导广泛范围的细胞类型，不能被人类血清激活，并有可能传导某些非分离及分离细胞。

改进基因表达。假设开发高效的基因能传导的话，那末接下来的目标便是使基因表达长效稳定在一个合适水平上，这正是当前载体最大的不足。虽然我们仅是在逆转病毒载体中讨论基因表达问题，但它可应用到所有类型的基因传导载体中。

基因转化后要保持稳定的表达，与几种因素有关。首先，控制基因表达的调节顺序不能经常保持活化状态。存在一种细胞认识外来催化剂的的趋势，（尤其如类人猿病毒40（SV40）和巨细胞病毒（CMV）），并不能激活它们（通过甲基化或其它机理）。到目前为止，仍很少掌握淋巴激活素、细胞素和其它生长因素在基因表达中的作用。其次，即使基因在细胞中保持活性但细胞经常死亡。为识别、消除外源基因产物及产生外源蛋白细胞而设计免疫系统，从逆转录病毒载体中消除所有病毒基因。所以，病毒蛋白的免疫识别（有一种情况例外，如病毒壳体蛋白被包埋在病毒颗粒中）不是目的（但见下面腺体载体的讨论）。尽管如此，免疫系统仍可能识别由治疗基因产生的新的或修正过的蛋白；一种新合成的正常蛋白将对从未为它暴露过的免疫系统作出反常表现。

细胞自身顺-调节DNA序列的使用将可能比用病毒催化剂获得更稳定长效基因表达，但要确认基因调节系统的所有成分可能是困难的。作为一种极端的情况，与血红蛋白（B-珠蛋白）基因部分调节有关的调节序列扩散超过近100kb。因为逆转录病毒仅能提供6—8Kb序列，所以被结合到这种载体前可能需要截断调节序列至它们的最小基本长度。甚至当使用天然调节分子时，因缺乏微弱信号和适宜细胞环境的正常操作反馈机理而不能校正功能。例如，当胰岛素增强剂/催化剂输送至成纤维细胞中去时仍不能调节表达。再有，要强调的是：需要开发具有基因转化成特殊细胞型能力的载体。

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