软件自动给出分析结果：
同样，结果自动给出了待测样品相对于对照组目的基因的表达情况。
比较定量法：
另一种相对定量分析方法叫比较定量法(ComparativeQuantitation)，该方法在芯片结果验证中的应用相对较多。
比较定量法的特点、注意事项及实际应用：
1．必需确定起始样品的总核酸浓度一致。在芯片验证时使用较多，但同样也必需有起始浓度一致的核酸样品。
2．作为常规的基因表达调控研究，建议研究者使用前两种定量方法。
3．该方法通过拐点时的循环数来进行相对定量比较，重复性更好。
4．该方法操作非常简便，无需做标准曲线及设置内参。使用时，样品均定义为unknown，分析时选用ComparativeQuantitation，确定对照组，完成分析。
应用实例：
用Comparative Quantitation法进行定量分析时，在保证起始总核酸量一致的前提下，只要对目的基因进行扩增即可，例：待测样品A、B、C，扩增目的基因。在软件中选择相应方法，即得以下结果：
上图左下方即相对表达量的结果，其中Rep.Conc为样品B、C相对于对照组A的目的基因浓度。右侧，可通过修改Calibrator Replicate改变对照组，以获得不同的比较结果。
