我们看到,在该客户的实验中,以样品A为对照组,软件自动组出了样品B和C的目的基因相对于样品A的表达情况。 这种方法对于样品量大,但研究的基因数目相对较少的客户特别有用,因为一旦条件优化好之后就无需再做标准曲线,节约了试剂和样品量,实验操作也相对简单。
双标准曲线法:
公式:
双标准曲线法考虑到了不同基因扩增效率的差异,用标准曲线来校正扩增效率。
双标准曲线法的特点、注意事项及实际应用:
1. 双标准曲线法做相对定量分析的最大特点是,应用简便,无需像Delta-delta CT法那样对实验进行严格的优化。
2. 其不足之处是每次实验都必需对目的基因和看家基因做两组标准曲线。
并且,如果用于做标准曲线的标准品不同于样品,比如标准品为质粒或纯化的PCR产物,而待测样品为cDNA,那么标准曲线的扩增效率并不能真实地反映样品的扩增情况,因此以标准曲线来计算样品的实际浓度就存在一定误差。
每种相对定量方法都会有一定的局限性,对于双标准曲线法,比较适合于样本量不大,但研究的基因较多的客户,这样对不同基因条件优化相对Delta-delta Ct法更为简单。
下面是某科研用户用双标准曲线法进行相对定量分析的实例。
要用该方法进行分析,客户在一轮反应中,对目的基因和看家基因分别做了一组标准曲线,同时也分别扩增的待测样品的目的基因和看家基因。
如下图,选择软件中相应的分析方法。



