试验程序
1.在纯净工作台上将5ml含AP的LB液体培养基加入到一10~15ml通气良好的试管中,然后将前述经鉴定含有目的DNA片断的转化细菌接种其中,37℃下振荡培养过夜。
2.取1.5ml培养物置于一微量离心管中,在4℃下12000rpm离心2min.,弃去上清液,使细菌沉淀尽可能干燥。
3.将细菌沉淀重悬于100μl溶液I中,剧烈振荡后加入200μl新配制的溶液II,盖紧离心管口,将其快速颠倒5次(切勿振荡),再加入150μl在冰上预冷的溶液III,盖紧离心管口,将其倒置后轻轻地振荡使溶液III在粘稠的裂解物中分散均匀,再将离心管置于冰上3~5min.。
4.在4℃下12000rpm离心5min.,将上清液移至另一离心管中。
5.加入等量酚∶氯仿(1∶1),振荡混匀,在4℃下12000rpm离心2min.,将上清液转入另一离心管中。
6.加入二倍体积95%乙醇,振荡混匀,室温放置20min.,在4℃下12000rpm离心5min.,小心弃去上清液,倒置将液滴除尽。
7.用70%乙醇洗涤一次,室温干燥10min.,用50μl含20μg/ml胰RNA酶(无DNA酶)的TE重新溶解质粒DNA,取1μl 在含溴化乙锭的微型胶上进行电泳检测,其余置于-20℃保存备用。
B.质粒DNA的线性化
试剂及其配制
Not I和Sal I内切酶及其相应的缓冲液
酚∶氯仿(1∶1)
3mol/L NaAc(pH 5.2)
100%和70% 乙醇
DEPC-H2O
试验程序
Sal I或Not I 2μl(10U/μl)
2.37℃保温反应2小时以上。
3.消化液用100μl的酚∶氯仿(1∶1)、氯仿各抽提一次,每次在在4℃下12000rpm离心5min.
4.将上清液转入一新的离心管中,加入0.1倍体积3mol/L乙酸钠和2倍体积乙醇沉淀过夜。
5.4℃下12000rpm离心20min.,弃去上清液,沉淀用70%乙醇洗涤一次,真空干燥。
6.线性化质粒DNA按0.25μg/μl的浓度重悬于DEPC-H2O中,取10μl电泳检测线性化质量,其余于-20℃下保存备用。
五、RNA探针制备(根据the DIG system user's guide)
A. 地高辛标记的体外转录
试剂及其配制(试剂盒提供):
10× NTP标记混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)
10mmol ATP
10mmol CTP
10mmol GTP
6.5mmol UTP
3.5mmol DIG-UTP
10× 转录缓冲液:400mmol Tris-HCl(pH 8.0)
60mmol MgCl2
100mmol DTE(dithioerythritol)
20mmol亚精胺
100mmol NaCl
1unit/mlRNase抑制剂。
10unit/μl DNase I (RNase-free)
20unit/μl Rnase抑制剂
20unit/μl T7 RNA聚合酶和T3 RNA聚合酶
4mol/L LiCl
200mmol/L EDTA
DMPC-H2O

