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Northern杂交试验指导手册
作者:未知 来源:生物秀 时间:2007-7-17


    试验程序
    1.在纯净工作台上将5ml含AP的LB液体培养基加入到一10~15ml通气良好的试管中,然后将前述经鉴定含有目的DNA片断的转化细菌接种其中,37℃下振荡培养过夜。
    2.取1.5ml培养物置于一微量离心管中,在4℃下12000rpm离心2min.,弃去上清液,使细菌沉淀尽可能干燥。
    3.将细菌沉淀重悬于100μl溶液I中,剧烈振荡后加入200μl新配制的溶液II,盖紧离心管口,将其快速颠倒5次(切勿振荡),再加入150μl在冰上预冷的溶液III,盖紧离心管口,将其倒置后轻轻地振荡使溶液III在粘稠的裂解物中分散均匀,再将离心管置于冰上3~5min.。
    4.在4℃下12000rpm离心5min.,将上清液移至另一离心管中。
    5.加入等量酚∶氯仿(1∶1),振荡混匀,在4℃下12000rpm离心2min.,将上清液转入另一离心管中。
    6.加入二倍体积95%乙醇,振荡混匀,室温放置20min.,在4℃下12000rpm离心5min.,小心弃去上清液,倒置将液滴除尽。
    7.用70%乙醇洗涤一次,室温干燥10min.,用50μl含20μg/ml胰RNA酶(无DNA酶)的TE重新溶解质粒DNA,取1μl 在含溴化乙锭的微型胶上进行电泳检测,其余置于-20℃保存备用。

    B.质粒DNA的线性化

    试剂及其配制
    Not I和Sal I内切酶及其相应的缓冲液
    酚∶氯仿(1∶1)
    3mol/L NaAc(pH 5.2)
    100%和70% 乙醇
    DEPC-H2O

    试验程序

    Sal I或Not I 2μl(10U/μl)
    2.37℃保温反应2小时以上。
    3.消化液用100μl的酚∶氯仿(1∶1)、氯仿各抽提一次,每次在在4℃下12000rpm离心5min.
    4.将上清液转入一新的离心管中,加入0.1倍体积3mol/L乙酸钠和2倍体积乙醇沉淀过夜。
    5.4℃下12000rpm离心20min.,弃去上清液,沉淀用70%乙醇洗涤一次,真空干燥。
    6.线性化质粒DNA按0.25μg/μl的浓度重悬于DEPC-H2O中,取10μl电泳检测线性化质量,其余于-20℃下保存备用。

    五、RNA探针制备(根据the DIG system user's guide)

    A. 地高辛标记的体外转录

    试剂及其配制(试剂盒提供):
    10× NTP标记混合物:in Tris-HCl (pH 7.5)
    10mmol ATP
    10mmol CTP
    10mmol GTP
    6.5mmol UTP
    3.5mmol DIG-UTP
    10× 转录缓冲液:400mmol Tris-HCl(pH 8.0)
    60mmol MgCl2
    100mmol DTE(dithioerythritol)
    20mmol亚精胺
    100mmol NaCl
    1unit/mlRNase抑制剂。
    10unit/μl DNase I (RNase-free)
    20unit/μl Rnase抑制剂
    20unit/μl T7 RNA聚合酶和T3 RNA聚合酶
    4mol/L LiCl
    200mmol/L EDTA
    DMPC-H2O

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