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Northern杂交试验指导手册
作者:未知 来源:生物秀 时间:2007-7-17


    试剂及其制备
    T4 DNA连接酶
    连接缓冲液(可直接购买或配制),10X 缓冲液配方为:
    0.5 mol/L Tris-HCl pH 7.8
    0.1 mol/L MgCl2
    50mmol/L 二硫苏糖醇(DTT)
    ATP 5mmol/L ( 如果直接购买商品缓冲液,有的已加在缓冲液中,但有些需单独加入)。
    BSA 0.25mg/L
    PEG (3500~8000均可,在缓冲液中加入2%~3% 的PEG可提高平端连接效率)。
    无菌蒸馏水(SDW)

    试验程序
    1. 建立以下反应体系(终体积20μl):
    4μl 质粒 ( 50μg/μl)
    6μl 目的DNA ( 100μg/μl)
    2μl 10X 连接缓冲液
    2μl DNA 连接酶
    6μl 无菌蒸馏水
    2. 反应管置于15℃条件下保温反应24小时,65℃加热10min.终止反应。
    3.取5~10μl连接反应物用微型凝胶电泳检测连接效果,其余反应物于-20℃保存备用。

    注意事项
    1.保证连接反应中目的DNA与质粒载体的浓度比例在3∶1,因为高浓度的DNA有利于片断与载体的连接,低浓度的DNA则会增加载体自连。
    2.DNA连接酶对温度敏感,在15℃以上会迅速失活,因此,连接反应的温度控制必须严格。
    3.为了保证RNA探针的质量,模板DNA片断的完整性和纯度十分重要,在DNA制备时要严格控制。

    C.感受态细胞制备(CaCl2>法)

    试剂及其配制
    LB培养基(200ml):2g胰蛋白冻、1g酵母浸膏、2g NaCl,溶解后调整pH至7~8,定溶到200ml混匀,分装成50ml/瓶后灭菌4℃保存。
    CaCl2 0.1mol/L,4℃保存。
    E. coli菌株:JM105或TG1。

    试验程序
    1.将单菌落菌株接种于5ml LB培养基中,在37℃条件下振荡培养过夜。
    2.取0.5ml过夜培养的菌液接种于50ml LB培养基中,在37℃条件下振荡培养约3小时,用分光光度计检测OD600=0.3~0.4时,取出培养瓶置于冰上完全冷却。
    3.将菌液转入离心管中,在4℃条件下,3500rpm离心5~10min.,弃去上清液。
    4.将沉淀悬浮于预冷的25ml 0.1mol CaCl2>中,在冰上放置30min.后,于4℃条件下,3500rpm离心5~10min.,弃去上清液。
    5.沉淀重悬于2ml 预冷0.1mol CaCl2溶液中,菌液直接用于转化。或加入1.6ml 80%甘油,按每管200μl分装于2ml的冻存管中,于液氮中速冻后-70℃保存备用。

    D. 质粒DNA转化

    试剂及其配制
    LB培养基(同C)。
    氨苄青霉素:用无菌蒸馏水配制成50mg/ml的贮存液。
    含氨苄青霉素(AP)的LB平板:每升LB培养基中加入15g琼脂,溶化后高压灭菌,待稍凉后再加入氨苄青霉素至终浓度为50~100μg/ml。在超净工作台上用9cm灭菌培养皿铺板。
    IPTG(isopropylthio-β-D-galactoside 异丙基硫代-β-D-半乳糖苷):取2g溶于8ml双蒸水中,定容至10ml,过滤灭菌后-20℃保存。
    X – Gal ( 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactoside 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷):贮存液浓度为20mg/ml,溶于二甲基甲酰胺中,-20℃黑暗保存。

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