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Northern杂交试验指导手册
作者:未知 来源:生物秀 时间:2007-7-17


    方法二、改良Krapp提取法

    试剂及其配制

    RNA抽提掖:
    母液:4mol 异硫氰酸胍
    20mmol EDTA
    20mmol MES
    pH 7.0
    工作液:取400ml母液加入1.7ml 2-ME贮存在4℃条件下备用。
    RNA重悬液:2mol LiCl
    10mmol NaAc
    调整终体积为250ml,pH 5.2,灭菌后贮存在4℃条件下备用。

    试验程序

    1. 取新鲜植物材料0.5~1g,冷冻干燥。如果必要可加入0.2g砂一起研磨,然后加入 10ml RNA抽提掖充分混匀。
    2.4℃条件下8000rpm离心10min.,将上层水相转移至一干净离心管中,加入等体积的酚/氯仿抽提掖,在4℃条件下8000rpm离心10min.。
    3.上清液转移至一干净离心管中,再用10ml氯仿洗上清液1次(加入10ml氯仿充分混匀后,在4℃条件下8000rpm离心10min.)。
    4.小心将上清液转移至另一干净离心管中,加入1/10 vol 3mol NaAc和2 vol冷无水乙醇,在-80℃条件下沉淀2小时。
    5.在4℃条件下8500rpm离心30min.,小心弃去上清液,沉淀重悬于RNA重悬液中,置于4℃条件下1小时。
    6.4℃条件下8500rpm离心10min.,弃去上清液,沉淀溶于适当体积的DEOC处理水中。检测后分装,置于-70℃条件下保存。

    二、RNA质量检测

    提取的RNA需要对其质量和数量进行检测。实验室常用的方法有紫外吸收值检测和电泳检测两种。

    方法一、紫外吸收检测

    试剂:TE ( 10mmol/L Tris, 1mmol/LEDTA)。
    dH2O

    试验程序

    1.预热紫外分光光度计10~20min.。
    2.取两个1ml的狭缝石英杯,一个装入1mlTE溶液作为空白校正液,用来校正分光度计零点及调整透光度至100。
    3.取4μl RNA待测样品加入另一比色杯中,加dH2O至1ml,用无菌石蜡膜堵住杯口,倒转混匀。
    4.将两个比色杯置于分光光度计中,调入射光波长,用空白溶液分别调整T至100、OD至0,然后测定样品在260nm、280nm、230nm的OD值。

    RNA浓度和纯度分析

    浓度计算:对于单链RNA,OD260=1.0时,RNA浓度为40μg/ml,按照上述稀释方式,即OD260=0.1时,其RNA浓度为1μg/ml。
    纯度分析:纯净的RNA样品其OD260/OD280的比值应介于1.7~2.0,小于此比值说明有蛋白或苯酚污染,如果比值大于2.0则可能被异硫氰酸胍污染;OD260/OD280比值应大于2.0,如果小于此比值说明有小分子及盐类污染。

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