▲变性电泳胶:
称取0.5g琼脂糖,加入47.5ml 1x MOPs,加热至琼脂糖熔化后,冷却至50℃左右,加入2.5ml甲醛,轻轻混匀后倒入电泳托上。
▲变性电泳缓冲液:
在250ml容量瓶内加入5ml甲醛,用1x MOPS定容至250ml
(二)动物组织totalRNA的提取
1.根据表1选择适当的组织量和相应的变性裂解液量,将变性裂解液分装到RNase-free的50ml无菌离心管中,冰浴5分钟。
2.将组织样品放入变性裂解液中,在高速下匀浆15-30秒/次,直到看不见组织和细胞碎片。
3.根据表1加入适量2M的乙酸钠(pH4.0),反复颠倒混匀4-5次。
4.根据表1加入适量酚/氯仿,加盖颠倒混合4-5次,再摇动10秒钟。
5.冰浴10分钟。
6.4℃,12000g离心20分钟。
7.小心转移上层水相于另一个RNase-free的无菌离心管中,内含所需的RNA。蛋白质和DNA分别留在了有机相和中间层。
8.加入等体积的异丙醇,-20℃沉淀30分钟以上。
9.4℃,12000g离心20分钟。
10.根据表1加入适量的变性裂解液重新溶解RNA。
11.加等体积的氯仿,加盖颠倒混合4-5次,再摇动10秒钟。
12.4℃,12000g离心20分钟。
13.小心转移上层水相于另一个RNase-free的无菌离心管中,加入等体积的异丙醇,-20℃沉淀至少30分钟。
14.4℃,12000g离心20分钟。
15.弃上清,加1ml75%的乙醇漂洗RNA沉淀。4℃,12000g离心10分钟。
16.弃上清,空气中干燥RNA沉淀,直至没有乙醇气味。用适量DEPC水充分溶解RNA沉淀。
17.取少量RNA用于测定OD值及电泳,其余置-80℃冰箱中保存。
表1
|
Mg# of tissue |
500 |
800 |
1000 |
|
变性裂解液(ml) |
5 |
8 |
10 |
|
2M NaOAC pH 4 (ml) |
0.5 |
0.8 |
1 |
|
水饱和酚 (mL) |
5 |
8 |
10 |
|
氯仿 (mL) |
1 |
1.6 |
2 |
|
异丙醇(mL) |
4 |
6 |
8 |
|
变性裂解液 (mL) |
0.5 |
0.8 |
1 |
|
异丙醇(mL) |
0.5 |
0.8 |
1 |
|
75% 乙醇(mL) |
1 |
1 |
1 |
|
DEPC-treated H20 (mL) |
0.5 |
0.8 |
1 |
(三)植物组织totalRNA的提取
1.先将研钵于-80℃冰箱中预冷,然后将1g样品在液氮中研磨成粉末状。
2.将粉末倒入盛有3ml变性裂解液的50ml离心管中,充分匀浆。(1g样品加入3ml变性裂解液)。
3.加入0.3ml(1/10体积)2M的NaAc(ph4-5)颠倒混匀。
4.加入3ml(等体积)的水饱和酚,充分振荡,再加入1ml(1/3)的氯仿,振荡。
5.冰浴10min。4℃,12000g离心10min
6.小心转移上清于另一离心管中,加入2倍体积的无水乙醇,-70℃沉淀至少1小时。
7.4℃,12000g离心20min。

