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cDNA文库组标准流程
作者:佚名 来源:生物秀 时间:2007-7-16

    3.用连续加样枪在96孔板中每孔加入10 µl Photoplasting Buffer。
    4.用灭过菌的10ul小枪头挑取单克隆白斑至含有Photoplasting Buffer 的96孔板中,振荡混匀。
    5.用连续加样枪将Lysis Buffer上样于凝胶中,每孔4 µl,用排枪将细胞与Protoplasting buffer混合液上样于凝胶中(细胞在Protoplasting buffer中不宜超过30-40 min),并点上Marker。
    6.调节电压为20V(小槽)或40V(大槽),电泳15min,使细胞充分裂解,将电压调高到200V,继续电泳1hr,照相。
    7.根据胶图粗略鉴定插入片段的大小及小片段率。
    2.菌落PCR
    1.取适量PCR薄壁管,置于冰上,每管先加入17.3ul的灭菌水。
    2.用灭过菌的10ul小枪头挑取单克隆白斑至灭菌水中,振荡混匀。
    3.依次加入:

    各试剂均加好后,离心机上甩一下,使之沉底,置于PCR仪上
    4.94℃,2min。

    6.待PCR反应进入4℃后,取下PCR薄壁管,取7ulPCR产物加入3ul溴芬兰跑电泳,同时上1Kb DNA ladder。半小时后照相,观察胶图,根据胶图粗略鉴定插入片段的大小及小片段率。
    7.将快速鉴定和菌落PCR检测合格的文库送检。

    八.pBlueScript cDNA库扩增
    1.试剂及配方:
    2 x LB (1升):
            20g    氯化钠
            20g    蛋白提取物
            10g    酵母提取物
          加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌
    2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)
    175ml  2 x LB液体
    25ml   甘油(100%)
    加入蒸馏水至200ml,压灭菌,置于4℃备用

    2.步骤
    1.将cDNA文库转入大肠杆菌,如DH5a(DH10B)后,取少量菌液涂布氨苄平板,以推算克隆总量。
    2.取一大小合适的三角瓶,根据克隆总量配制2 x LB液体,每500ml 2 x LB液体可扩增5x105个克隆,可以适当增加2 x LB液体的量,但不能少于此比例
    3.按每100ml加0.3g的比例在2 x LB液体中加入SeaPrep agarose
    4.70℃加热搅拌至琼脂糖溶解,高压灭菌后再70℃搅拌30分钟.
    5.37℃放置1小时
    6.加入适量安苄青霉素,使之终浓度为50ug/ml
    7.加入全部菌液,并轻柔旋转使之混匀,避免振荡
    8.将三角瓶置于冰水中1小时,水面必须没过三角瓶内液面
    9.轻轻取出三角瓶,30℃培养40-45小时
    10.将三角瓶内容物全部转入离心管中,离心10,000g ,20分钟,必须室温
    11.弃上清,每100ml培养基离心得到的沉淀用10ml 2x LB-甘油(12.5%)重悬.
    12.将重悬液留下10ul检测滴度,其余分装于1.5ml离心管,-80℃冰箱内保存
    13.取1ul扩增后菌液倍比稀释.
    14.各取10ul 稀释为10-5和10-6的菌液涂布于含安苄青霉素的LB固体平板上,37℃过夜培养,次日计算其克隆数以及扩增后总克隆数.

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