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目的基因片段的PCR扩增与克隆
作者:佚名 来源:生物秀 时间:2007-6-9


    (2)目的片段与T载体的连接和转化
    采用PromegaT载体克隆试剂盒(pGEM-TEasySystemIkit)进行DNA片段克隆,具体步骤如下:
    1)按下表混合各反应成分;
    T载体连接反应体系

    试剂

    标准反应

    阳性对照

    空白对照

    10×T4连接缓冲液

    0.5µl

    0.5µl

    0.5µl

    pGEM-T载体(50mg/ml

    0.5µl

    0.5µl

    0.5µl

    PCR产物(回收)

    2.5µl

    ――

    ――

    阳性对照

    ――

    1µl

    ――

    T4-DNA连接酶(3U/µl

    0.5µl

    0.5µl

    0.5µl

    dd H2O

    1µl

    2.5µl

    3.5µl

    总体积

    5µl

    5µl

    5µl

    2)4℃,连接过夜;
    3)每个连接反应准备两个含氨苄青霉素的LB培养基,使用前半小时均匀涂布IPTG和X-Gal在平板表面;
    4)将感受态细胞放入冰盒中,解冻后迅速加入2μL待转化的质粒DNA溶液,混匀。
    5)在超净工作台上取950μL37℃预热的LB到最小的锥形瓶中,迅速拿到电转化仪旁。
    6)将菌液靠壁全部加入电转化杯中,在桌面上敲两下。设置电击参数:
    7)1,300V,5ms,按下start开始电击。迅速取出电击菌液,将预热好的LB加入,用枪将槽中菌液轻打混匀,并将所有菌液全部转入5mL管中,
    迅速置于37℃摇床,150rpm,培养1小时。
    8)取菌液50~100μL涂布在含氨苄青霉素、IPTG和X-Gal的LB平板上,37℃培养过夜,筛选转化子。注意要设空白,及质粒DNA对照。

    (3)克隆片段的检测-1
    1)在LB平板上挑取白色单菌落,置于2ml含氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃、200rpm振荡培养12-16小时;
    2)4℃、12,000rpm离心30秒,收集细胞沉淀;
    3)碱裂解法提取并纯化质粒DNA;
    ①将细菌沉淀,菌体重悬于100µl用冰预冷的溶液I中,剧烈振荡;
    ②加新配制的溶液II200µl,盖紧管盖,迅速颠倒混匀,将离心管放置于冰上;
    ③加150µl用冰预冷的溶液III,盖紧管口,将管倒置后温和地振荡10秒,使溶液III在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之后将管置于冰上3-5分钟;
    ④用微量离心机于4℃、12,000rpm离心5分钟,将上清液移到另一离心管中;
    ⑤加等量酚:氯仿(V/V),振荡均匀,用微量离心机于4℃、12,000rpm离心2分钟,将上清液转移到另一离心管中;
    ⑥用2倍体积的乙醇沉淀双链DNA;
    ⑦用微量离心机于4℃、12,000rpm离心5分钟;
    ⑧小心吸取上清液,将离心管倒置于吸水纸上,使其中液体流尽;
    ⑨用1ml75%乙醇洗沉淀的DNA,在空气中干燥10分钟,加入适量TEbuffer(10-20µl)溶解;
    (溶液I、溶液II、溶液III的配制见表9)
    质粒DNA的提取试剂

    溶液I

    溶液II

    溶液III

    50mmol/L 葡萄糖

    0.2mol/L NaOH (用前配制) 

    5mol/L乙酸钾(60ml

    25mmol/L Tris.HClPH8.0

    1SDS

    冰乙酸(11.5ml

    10mmol/L EDTA  (PH8.0)

     

    蒸馏水(28.5ml

    4 插入片段检测:
    以相应的插入片段的PCR引物对抽提的质粒DNA进行扩增(条件与第一次PCR相同),然后在0.8%的琼脂糖凝胶电泳检测是否有目的插入片段及插入片段大小

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