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目的基因片段的PCR扩增与克隆
作者:佚名 来源:生物秀 时间:2007-6-9

    (1)pGEM®-TEasy载体系统
    I.描述
    pGEM®-TEasy载体系统可用于PCR产物的克隆。这种载体是通过EcoRⅤ酶切pGEM®-5Zf(+)和pGEM®-TEasy载体,并在3’末端加入胸腺嘧啶构建的。插入位点3’-T突出端可提高PCR产物的连接效率,因为3’-T突出端可以防止载体的自身环化,并且为热稳定性聚合酶(1,2)产生PCR产物提供一个匹配碱基。如表1总结的,这些聚合酶常常以不依赖模板方式在扩增产物的3’端加上一个脱氧腺苷酸(3,4)。pGEM®-TEasy高拷贝数载体包含有T7和SP6RNA聚合酶启动子,其侧翼和多克隆位点区相接,多克隆位点区位于β半乳糖苷酶的α肽编码区内。α肽插入失活允许在指示培养基用颜色直接筛选重组克隆。另外这两个载体的多克隆位点区的限制性酶切位点适用于采用Promega公司Erase-a-Base®系统(产品目录号#E5750)产生一系列巢式缺失体。
    pGEM®-TEasy载体的多克隆位点区含有一些这样的限制性酶切位点,采用这些酶进行单酶切消化即可释放插入片段。如pGEM®-TEasy载体多克隆区的EcoRⅠ、BstZⅠ和NotⅠ酶切位点。这种载体也可选用适当的双酶切消化释放插入片段。
    pGEM®-TEasy载体含有丝状噬菌体f1复制起始子,可用于制备单链DNA(ssDNA参见第Ⅶ部分)。单链DNA分子对应于图1底部一条链,代表pGEM®-TEasy载体。
    pGEM®-TEasy载体系统包含2×快速连接缓冲液,用于连接PCR产物。采用这种缓冲液进行连接,在室温孵育1小时即可完成。延长孵育时间可增加转化克隆菌数目。一般4℃过夜连接可产生最多的转化子。
    表1.部分热稳定性DNA聚合酶所产生的PCR产物特性的比较。
    热稳定性DNA聚合酶

    特性

    Taq/

    AmpliTaq®

    Tfl

    Tth

    Vent®/(Tli)

     

    Deep Vent®

    Pfu

    Pwo

    PCR 产物末端

    3’A

    3’A

    3’A

    >95%平端

    >95%平端

    平端

    平端

    5’-3’外切酶活力

    3’-5’外切酶活力

    II. 载体图谱

    GEM®-T Easy 载体的启动子及多克隆位点区序列 。上部序列链对应于用T7 RNA 聚合酶合成的RNA 序列,底部序列链对应于用SP6 RNA 聚合酶合成的RNA 序列。

    pGEM®-T Easy 载体环形图谱及相关的序列位点

    pGEM®-TEasy载体相关的序列位点:
    T7RNA聚合酶转录起始位点1
    克隆位点区10-128
    SP6RNA聚合酶启动子(-17至+3)139-158
    SP6RNA聚合酶转录起始位点141
    pUC/M13反向测序引物结合位点176-197
    lacZ起始密码子180
    lac操纵子200-216
    β内酰胺酶编码区1337-2197
    噬菌体f1区2380-2835
    lac操作子序列2836-2996,166-395
    pUC/M13正向测序引物结合位点2956-2972
    T7RNA聚合酶启动子(-17至+3)2999-3

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