step1 94℃ 5 min 预变性
step2 94℃ 1 min 变性
step3 X℃ 1 min 复性
step4 72℃ y min 延伸
step5 GO TO step2 30循环
step6 72℃ 10 min 延伸
step7 4℃ 10 min 保温
step8 End
扩增产物于0.8%的琼脂糖凝胶80伏电泳2 h,溴乙锭染色,凝胶成像仪观察分析扩增结果。若扩增谱带明显,并具有特异性,则挖带进行进一步扩增;若扩增谱带不明显,或特异性较差,则改变PCR条件,直到扩增出特异谱带。
凝胶加样缓冲液:0.25%溴酚兰;0.25%二甲苯青FF;40%(w/v)蔗糖水溶液;1×TAE
在琼脂糖凝胶中溴酚兰相当于35bp,二甲苯青相当于130bp。
目的DNA片段的进一步扩增
1 在长波紫外灯下切取特异的扩增谱带
2 将挖取的琼脂糖凝胶置于1.5ml Eppendorf管中,加50µl TE,用枪头捣碎凝胶后于45℃水浴30min。
3 离心5分钟后,取上清夜继续进行PCR,反应条件同第一次PCR。
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体系各成分 |
用 量(μL) |
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10×Taq buffer |
5.0 |
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引物1(20p mol L-1) |
1.0 |
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引物2(20pmol/μL) |
1.0 |
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MgCl2( |
5.0 |
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4dNTP( |
5.0 |
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Template DNA |
32.5 |
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Taq酶(3U) |
0.5 |
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总体积 |
50 |
取5μL检测是否为特异单带。若为特异单带,则直接用2倍预冷的乙醇沉淀(加1/10体积5mol/LNaAc,2倍体积乙醇,-20oC放置1小时或过夜。离心(12000g,20min),沉淀用75%洗2次,DNA自然晾干,溶于1mol/LpH8.0的TE溶液中,贮于4℃待用);若为多带,则琼脂糖凝胶电泳后,在长波紫外灯下切取目的DNA片段,用DNA回收试剂盒回收。
2.用E.Z.N.A.GelExtractionKit进行回收
a)用0.8%琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段,在紫外灯下切取目的片段,放入Eppendorf管。并称重。
b)每管加入等体积的Bindingsolution(约100μL/0.1g),60℃水浴7min至凝胶完全融化,其间温和地混合几次。c)在Hind®DNAspin中加入700μLDNA/琼脂糖混合液。室温下,10,000rpm,离心3min,去上清。若DNA/琼脂糖混合液体积大于700μL,每次取700μL,连续装柱、离心。(注:每柱最多回收25~30μgDNA)
d)加入300μLBindingbuffer,室温下,10,000rpm离心10min,弃上清。
e)每管加入700μL的无水乙醇稀释的spwbuffer到柱中,静置3min,室温下,10,000rpm离心1min。
f)弃上清,10,000rpm离心空管1min。
g)转移柱至一个干净的1.5mL离心管中,每管加20μLDNAElutionbuffer,室温下,10,000rpm离心1min。上清夜即为纯化的DNA片段。
3.目的片段的克隆
纯化的片段连接到克隆载体pGEM-Tvector,转化导入宿主菌E.coliDH5α,通过蓝白斑筛选,PCR扩增鉴定后测序,获得的含所需要的目的片段的质粒。

