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核酸序列分析软件DNAssist小教程
作者:DNAssist 来源:丁香园 时间:2007-5-31

    我始终抱着这样的想法,“一个例子学会一个软件的基本使用”。其实用几分钟就可以学会那些我们经常需要使用的功能。感谢jnuxzzyh961171网友的加盟,让我们把领初学者进门的努力进行到底!

    做DNAssist的StepByStep的时候,我想起了刚上博士的时候在实验室里,我们拿到测序结果时,通常要找个师兄弟,一个人“ATGC……”地高声念着期望的序列,一个人听着,“塔塔塔……啪”地三下光标一下空格键地把测序结果分成一个个密码子,看碱基序列和阅读框有没有出现错误。每当有节奏的“塔塔塔……啪”的声音响起,我们就知道,又有人的测序结果来了。那里可是一个巨牛的实验室啊!直到有一天有个人不经意地说,有个软件可以对测序结果的……

    软件下载地址:http://www.bbioo.com/Soft/2005/109.htm

    DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA,RNA和蛋白质的基本数据,对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序报告(序列比对);②DNA的物化性质、限制性酶切位点图谱分析;③分析蛋白质的物化性质、抗原性、疏水性。

    1. 安装好DNAssist1.0后,从开始/程序中打开这个软件。

    .打开后的界面如图。

    3. 现在我们来进行一个序列比对(Align)。我常这样对比测序报告;或看某个基因在融合蛋白基因的哪个位置等。这里说对测序结果。建立一个新的DNA序列,即file/new/DNA。然后把预期的DNA序列(如AB-CTB)拷进去。注意:只能是纯粹的ATGC,而不能有空格和其他字母,否则不能拷贝进去!

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