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序列分析软件DNAMAN 的使用方法简介
作者:吕惠平 来源:生物秀 时间:2007-5-31

    DNAMAN 是一种常用的核酸序列分析软件。由于它功能强大,使用方便,已成为一种普遍使用的DNA 序列分析工具。本文以DNAMAN 5.2.9 Demo version 为例,简单介绍其使用方法。
    打开DNAMAN,可以看到如下界面:


    第一栏为主菜单栏。除了帮助菜单外,有十个常用主菜单,如下所示


    第二栏为工具栏:如下所示:


    第三栏为浏览器栏:如下所示:

    在浏览器栏下方的工作区左侧,可见Channel 工具条,DNAMAN 提供20 个Channel,如左所示:
    点击Channel 工具条上相应的数字,即可击活相应的Channel。每个Channel 可以装入一个序列。将要分析的序列(DNA 序列或氨基酸序列)放入Channel 中可以节约存取序列时间,加快分析速度。此版本DNAMAN 提供自动载入功能,用户只需激活某个Channel , 然后打开一个序列文件, 则打开的序列自动载入被激活的
    Channel 中。
    本文以具体使用DNAMAN 的过程为例来说明如何使用DNAMAN 分析序列。

    1.将待分析序列装入Channel
    (1)通过File|Open 命令打开待分析序列文件,则打开的序列自动装入默认Channel。(初始为 channel1)可以通过激活不同的channel(例如:channel5)来改变序列装入的Channel。

    (2)通过Sequence|Load Sequence 菜单的子菜单打开文件或将选定的部分序列装入Channel。
    可以通过Sequence|Current Sequence|Analysis Defination 命令打开一个对话框,通过此对话框可以设定序列的性质(DNA 或蛋白质),名称,要分析的片段等参数。

    2.以不同形式显示序列
    通过Sequence|Display Sequence 命令打开对话框,如下图所示:

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