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NCBI(美国国立生物技术信息中心)资源介绍及使用手册
作者:未知 来源:中科院上海生命科学研究院生物信息中心 时间:2006-12-27

    绘制的标记

    dbSTS —序列标签位点的数据库,短的在基因组上可以被唯一操作的序列,因而可以确定在物理图谱上的特定位置。

    电子PCR(e-PCR) — 找到一个查询序列的假设位点图。用于在DNA序列上发现STS位点计算过程。

    GeneMap’99 — 〉35000个人类基因标记的物理图谱,由国际放射杂交图谱联合用一致的RH试剂和方法建成。提供了突出了染色体上关键标志(富含基因区)的框架,从而加速了测序,代表了超过100名科学家的国际合作努力。

    人类基因组测序 — 绘制的标记已经用e-PCR自动被放到完成的HTG序列组成的contig上。标记来源于dbSTS, GeneMap'99(基于基因的标记),Stanford G3 RH单子(又有基因标记也有非基因标记),Whitehead GB4 RH单子和YAC图谱(又有基因标记也有非基因标记),Genethon遗传图谱,和一些染色体特异的图谱,如NHGRI的7号染色体图谱,Washington University的X染色体图谱。

    OMIM基因图 — 被报道的和被许多定位方法决定的基因的细胞遗传位点。可以用基因代号或细胞遗传染色体位点来搜索。可以从OMIM页面上访问。

    基因表达

    CGAP cDNA表达谱 — 在UniGene簇和cDNA库中的ESTs分布。可以在CGAP页面上访问。

    SAGEmap — CGAP SAGE(Serial Analysis of Gene Expression)库的差异显示。也包含了对在人类GenBank记录中的SAGE标签的完整分析,在人类GenBank记录中一个UniGene的标志被分配给了每个含有一个SAGE标签的人类序列

    遗传变异

    dbSNP — 单核苷酸多态性数据库,包括SNPs,小范围的插入/缺失,多态重复单元,和微卫星变异。DbSNP包含种族特异的频率和基因型数据,实验条件,分子上下文,及中性多态和临床变异的定位信息。

    OMIM — 在线人类孟德尔遗传—约900个OMIM记录的等位变异。为了查看这些OMIM记录的列表,在等位变异字段上搜索“0001”。或者,把一个疾病的名字同“0001”放到一起。如:Gaucher & 0001。

    位点特异突变数据库 — 从OMIM主页和相关的LocusLink条目链接到许多外部数据库。

    失调

    基因和疾病 — 介绍遗传因素和人类疾病的关系。有约60种遗传疾病的概要信息,以及链接到相关数据库和组织。

    Mitelman癌症染色体变异摘要 — 由Drs. Mitelman, Mertens, 和 Johansson建立的基因组范围的人类癌症中染色体断裂位点图谱。参见Nature Genetics, Vol. 15(Spec. No.):417-74 (April 1997)的超文本版本。

    OMIM — 在线人类孟德尔遗传—经常更新的人类基因和遗传失调的目录,有链接到其它相关的文献参考,序列记录,和相关数据库。

    OMIM Morbid Map - alphabetical listing of diseases and corresponding cytogenetic map locations, with links to OMIM entries. Accessible from OMIM page (see Genes).

    OMIM致病图 — 按字母排列的疾病和相应的细胞遗传图位点,链接到OMIM的条目。可以从OMIM页面访问。

    癌症研究

    CCAP — 癌症染色体变异计划—计划用来加速同恶性转移相关的显著染色体变异的定义和详细的特征描述。

    CGAP — 癌症基因组剖析计划 — 交叉学科项目,目的是基于cDNA库,鉴定在不同癌症阶段的人类基因表达,和决定正常,癌前和恶性细胞的分子表达谱。是NCI,NCBI和其它许多实验室的合作。

    Mitelman癌症染色体变异摘要 — 由Drs. Mitelman, Mertens, 和 Johansson建立的基因组范围的人类癌症中染色体断裂位点图谱。参见Nature Genetics, Vol. 15(Spec. No.):417-74 (April 1997)的超文本版本。

    SAGE分析 — 在癌症库中的SAGE标签的差异表达

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