生物秀首页 新闻前沿 产业资讯 实验技术 仪器教程 生物考研 资源下载 生物人 物秀商城 生物论坛 图片 专业 博客 易生物 视频动画
生命科学实验中心
导航: 生物秀 > 实验 > 文献检索 > 正文
  • 倾力提供最优!
  • 生物秀实验频道
NCBI(美国国立生物技术信息中心)资源介绍及使用手册
作者:未知 来源:中科院上海生命科学研究院生物信息中心 时间:2006-12-27

    果蝇基因组

    黑腹果蝇主页 — 提供所有可使用的果蝇资源的概要,用图形的方式显示了染色体,允许你通过Entrez基因组浏览器的方法来搜索整个基因组的细胞遗传和序列信息。Entrez基因组提供了对于一个物种一致的遗传,物理,和序列数据的图形界面。当你用一个基因的代号来搜索时,它给出搜索结果的一个图形的基因组视图,从那你可以放大到你所感兴趣的区域的更详细的图谱视图,并且链接到序列数据和包含更多信息的相关资源。

    黑腹果蝇基因组测序的状态 —描述了目前在GenBank,Entrez Genomes,和FTP站点中的数据的范围

    Entrez图谱浏览器 — 整合的染色体图谱—图谱浏览器是Entrez基因组的一个软件组成部分,用来显示一个或多个用共同标记或基因名字互相align过的图谱,以及用相同序列进行比较过的序列图谱。在人类基因组数据和搜索技巧文件中有关于目前可以使用的果蝇的序列和细胞遗传学图谱。Entrez图谱浏览器的帮助文件提供了关于如何使用这个工具的一般说明。

    位点链接(LocusLink) — 为校正过的序列和遗传位点的描述信息提供一个单次查询界面。LocusLink给每个位点发布一个稳定的ID,并提供官方的命名,序列accesssion number, Unigene簇,图谱信息,和相关的网址。LocusLink是NCBI,人类基因命名委员会,OMIM和其它组织的合作结果。LocusLink目前包含人类,小鼠,大鼠,斑马鱼,和果蝇的位点,物种可以被分开或合在一起查询。

    线虫基因组

    Entrez基因组 — 染色体的图形表示,可以整个的查看,也可以逐步放大的看。链接到相关的序列数据。

    酵母基因组

    Entrez基因组 — 染色体的图形表示,可以整个的查看,也可以逐步放大的看。链接到相关的序列数据。

    COGs — 相邻类的聚簇 — 来自于完整基因组的基因家族自然系统。COGs用比较21种完整的基因组的编码的蛋白序列描绘了17个主要的种系发生系统。每个COG包含至少来自3个世系的独立蛋白或蛋白家族的相邻体,所以对应了一个古老的保守domain。

    疟原虫基因组

    疟原虫遗传学和基因组 — 提供与疟原虫遗传学和基因相关的数据和信息。资源包括物种特异的序列BLAST数据库(恶性疟原虫,所有疟原虫,以及弓形虫),基因组图谱,连锁标记,以及遗传学研究信息。链接到其他的疟原虫网站和相关的寄生虫遗传学数据库包括弓形虫。

    Entrez基因组 — 恶性疟原虫的染色体全长的图形视图,完整的染色体序列数据(2和3),链接到正在进行的染色体的分离数据表(来自于HB3 X Dd2杂交的染色体),链接到其他基因组测序中心。

    FTP站点 (pub/Malaria目录)— 用于查找在DNA序列中STS的电子PCR疟原虫版。

    FTP站点 (genbank/genomes 目录) — 下载各种格式的完整的染色体序列数据(2和3),包括GenBank的flat file (*.gbk),GenBank的概要文件(*.gbs),FASTA核酸文件(*.fna),FASTA氨基酸文件(*.faa),蛋白表(*.ptt)和其他。

    细菌基因组

    Entrez基因组 — 完整细菌基因组的图形表示,可以整个的查看,也可以逐步放大的看。链接到相关的序列数据。对每一个细菌都提供了一个编码区域的概要和TaxTable。

    微生物基因组测序计划 — 完成的和正在进行的测序计划,链接到NCBI的图形视图和测序中心。

    COGs — 相邻类的聚簇 — 来自于完整基因组的基因家族自然系统。COGs用比较21种完整的基因组的编码的蛋白序列描绘了17个主要的种系发生系统。每个COG包含至少来自3个世系的独立蛋白或蛋白家族的相邻体,所以对应了一个古老的保守domain。

    FTP站点— 下载各种格式的完整的细菌染色体序列数据,包括GenBank的flat file (*.gbk),GenBank的概要文件(*.gbs),FASTA核酸文件(*.fna),FASTA氨基酸文件(*.faa),蛋白表(*.ptt)和其他。

    微生物基因组BLAST数据库 — 与完成的和未完成的微生物基因组进行BLAST。

     << 上一页  [11] [12] [13] [14] [15] [16] [17] [18] [19] [20]  ... 下一页  >> 

关于〖NCBI(美国国立生物技术信息中心)资源介绍及使用手册〗的最新评论
昵称:      评分: 1分 2分 3分 4分 5分
内容:
生物秀实验频道
设为首页 | 加入收藏 | 关于我们 | 战略伙伴 | 友情链接 | 法律声明 | 广告服务 | 联系我们 | 网站地图
Copyright © 2003-2008 生物秀 (中国·生物秀科技) 版权所有 信产部备案:鲁ICP备05001831号
客服信箱:info@bbioo.com  客服电话:15800302289  客服QQ:254857951
www.bbioo.com All Rights Reserved.