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Western Blot详解(原理、分类、试剂、步骤及问题解答)
作者:未知 来源:根据biox编辑 时间:2006-12-13

    YYY. 半干法转移与胶的面积和蛋白分子两大小好像都有关系,那么湿法转移是不是所有的转移条件都一样呢?一般的条件是怎样的?
    解答:半干转的电流大小是按照面积来算的,时间是根据蛋白分子大小定的;而湿转的话电流是恒定的,时间也是根据分子量而定。

    ZZZ. 转膜时何为湿法,何为半干法?
    解答:半干法和湿法转移是两种不同的转移装置下的转移系统,将膜,胶,滤纸整个浸泡在buffer的Tank里转移的,叫湿法;用滤纸吸buffer来做转移体系的叫半干法。

    AAAA. 为什么浓缩胶和分离胶的电压不一致?同样的电压可以吗?
    解答:浓缩胶的目的使得loading 的样品能够在同一条水平线上进入分离胶 ,如果电压太大前端的蛋白容易在后面的蛋白赶上来前进入分离胶。而在分离是理论上(实际上也是)小电压长时间分离的效果会更好,但是在操作过程中没有必要等那么长的时间,所以就用大电压快点跑。

    BBBB. 如果目的蛋白比较小,21和38kd,转膜时(Biorad的湿转仪)时间是否能缩短些?100伏电压,甲醇的量是否也可以相应增加?

    解答:如果是小蛋白可以用小电压28V-36V,4-6hours,(4度)。甲醇10%-20%就可以了。

    DDDD. 显色目的条带又细又浅,靶蛋白是27KD的bcl-xl和67KD 的c-myc,应该是高表达。每个涌道上50-70μg蛋白,开始用半干转移,后来用湿转14v,16h,用PVDF膜转移。胶转移后染色检测,发现小分子量的基本转移走了,可是为什么条带老是不粗不浓呢?
    解答:可能跟你的一抗有关系,还有应该高表达,那实际做的阳性对照是否是高表达;还有跟抗原量相关,你多上点蛋白会好的多;跟显色条件相关。

    EEEE. 背景很花,当然条带也很淡,如果我在显影液中多洗一会儿,背景就很深,以致无法辨认,但有时条带又很明显,背底很淡。
    解答:这跟你washing的时间和强度有关,很可能你在这方面没有掌握好。显影时间是有范围的,久了肯定不行。

    FFFF. 纯化过的目的带包括其上下都出现了色带,而且对照菌也出现了条带,会是什么原因?
    解答:一抗有问题,效价太低,且未纯化;表达量太低;提蛋白时可能出了问题。

    GGGG. 做Western Blot的检测的时候,用DAB显色还能看出条带,但是换成ECL的时候什么样结果都没有。我用的NOVA公司的发光底物,胶片是普通的X片,定影液和显影液都是别人留下来的,不知道是什么原因?
    解答:一般的说,Ecl比DAB更灵敏,但是DAB是HRP最敏感的底物,所以有几种可能:
    ECL底物失活了,你可以检测一下;敏感度正好不到ECl底物的范围。DAB能显色可不能催化ECL底物;显影液没用了。

    HHHH. 怎样分析结果,需要什么软件?
    解答:如果你做定量或办定量,至少要用到一个光密度扫描分析软件,如果不是,直接分析就可以了。

    IIII. 积层胶、分离胶一般多少左右合适?
    解答:一般电泳是积层胶60-80v,分离胶100v。

    JJJJ. 采用生物素标记的二抗-SABC-DAB检测系统做western,非特异性的条带和背景高?总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比较清楚,条带也很窄,可是越靠下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起了,这是什么原因,如何解决?sds-page的时候恒压和恒流哪个好?
    解答:非特异性的条带和背景高:可能性太多了,一抗,二抗,封闭的原因都可能。
    总蛋白考染的时候发现接近积层胶的条带比较清楚,条带也很窄,可是越靠下面的条带越来越宽,有的跑得都连在一起了,这是什么原因,如何解决?正常的,另外,是否是你的积层胶有问题。sds-page的时候,恒压和恒流都可以用。

    KKKK. 血清样品进行Western Blot 分析,目的蛋白21kD,结果显色出来后,目的条带很淡,而白蛋白和IgG条带很浓?
    解答:可能是因为白蛋白为67kD和目的蛋白相差教大,且他的浓度较低,你可以以底物二氨基联苯胺和0.01%过氧化氢溶液显色的时间延长为30分钟,再用去离子水漂洗以终止反应;也可能是抗体的特异性不好。把封闭的时间延长,同时提高封闭液的浓度,可以减少以下背景噪音。同时洗的时候要彻底,而目的条带弱,说明浓度不足,如果不考虑后续功能的话,你可以过G-50(细)柱子,纯化你的靶蛋白,接着真空冷冻浓缩,可以得到很漂亮的结果。

    LLLL. Western转膜已经成功了,但是Marker泳道未见蛋白条带(正常应该有6条),其余各泳道均有清晰的蛋白条带,经考马斯亮蓝染胶,结果相同。经5%的脱脂牛奶封闭1小时45分钟后,进行一抗孵育(1:200,建议起始浓度)过夜,二抗孵育5个半小时(1:2000),均在室温下,DAB显色,虽出现蛋白条带,但较弱,且出现非特异性条带。请问:1、Marker是MBI公司的,可分离14-116KD的蛋白,买了大概有一年的时间,是否有问题?2、一抗(为多克隆抗体)、二抗的浓度及孵育的时间是否合适?
    3、封闭的时间是否太短?
    解答:1. marker 有可能被降解了, 也有可能是它标称的上样量太少,不够,我做过一个标称每次5ul可我上了20ul才行的。
    2.建议,一抗4度过夜也很好, 建议1:100,室温2hrs就够了,
    3. 二抗室温1小时,1:2000,我喜欢4度封闭过夜(室温2hr就够了),1抗室温1hr,2抗室温1hr,最好是一抗4度过夜(或室温2小时)1:200,2抗室温1小时1:2000, 换ECL法。

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