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定量PCR实验数据处理
作者:陈云地 来源:appliedbiosystems 时间:2006-12-11


    管家基因—IPC

    􀂋通常以uL或者ug为单位取样

    􀂋细胞培养液:同样体积,细胞数目并不同样

    􀂋DNA溶液:抽提效率和操作误差,同样体积的DNA并不来源于同样数目的细胞

    􀂋copy/uL要校正成copy/cell才有意义



    IPC的定义
    ••什么是什么是IPCIPCIPC通常选用管家基因它与目标基因在相同的PCR条件下具有相似的扩增效率
    ••IPCIPC的作用的作用监控PCR抑制物、DNA/RNA提取的损失、操作误差等对定量数据的影响,并对以上原因造成的定量误差进行修正。
    IPC的选择标准
    -在所有待测样品中,内对照(Endogenous Control)的表达量都恒定不变
    -注意所选基因是否是组织依赖的、发育阶段依赖的、或者处理方式依赖的
    -多重定量时,内对照的表达量最好比目标基因高
    -推荐使用Human Endogenous Control Plate (P/N 4309920)测试不同管家基因的效果
    -常用的内对照有18S rRNA、β-actin、GAPDH等

    •在使用TaqMan MGB探针的情况下,你认为管家基因与目标基因是在同一管内做多重定量好,还是分成两管分别定量好?哪一种检测的数据更精确?

    扩增效率要一致

    曲线斜率< 0.1

    校准荧光ROX

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