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定量PCR实验数据处理
作者:陈云地 来源:appliedbiosystems 时间:2006-12-11


    梯度稀释方法
    选择目标、提取/PCR、纯化、测定浓度、调整浓度、梯度稀释
    CT值在18-30之间,覆盖全部样品浓度区间
    10倍连续梯度稀释方法:
    1v原液(标准品i) +9v稀释缓冲液,得标准品ii
    1v标准品ii+9v稀释缓冲液,得标准品iii
    1v标准品iii +9v稀释缓冲液,得标准品iv
    1v标准品iv +9v稀释缓冲液,得标准品v
    切不可由标准品I分别加不同体积的稀释缓冲液直接得到标准品ii、iii、iv、v

    标准品单位
    标准品的性质决定最终结果的性质:
    DNA标准品,已知拷贝数→绝对定量,得未知样品拷贝数
    DNA标准品,已知ng/uL→绝对定量,得未知样品ng/uL
    DNA标准品,未知拷贝数或浓度,已知稀释倍数→相对定量,得未知样品之间相差倍数
    RNA标准品,已知ng/uL,与未知样品同样反转录,梯度稀释cDNA→相对定量,得未知样品ngRNA/uL
    􀂋注意测定对单位的要求
    如果要求测定样品的基因拷贝数,→梯度稀释已知摩尔浓度的DNA片段
    如果要求测定样品的重量百分比[%(w/w)],如转基因,标准品是将转基因与非转基因食品粉末按重量比混合,然后抽提混合DNA;切不可先抽好转基因DNA,再梯度稀释,也不可分别抽提转基因与非转基因DNA,再按重量比例混合(这样得出的是基因重量百分比,而不是样品重量百分比)

    PCR效率对定量结果的影响

    测定PCR效率

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