2 执行数据文件
关闭例子文件并按以下操作:
Mac 和Windows
. 选择 File > Execute "primate-mtDNA-interleaved.nex"
Portable
. 在系统提示行输入paup. PAUP*将显示该程序的一般信息并在paup提示行显示光标.
. 输入: execute primate-mtDNA-interleaved.nex;
在执行这个例子文件后,PAUP 将显示关于这个数据的评论和一般信息.如,显示关于这个数据矩阵的维数和数据类型等等的部分,接着是显示这个数据设置的来源. 到这里,还没有进行数据分析;PAUP 只是简单的处理了这个数据,并等待执行下一步的命令.
记录日志结果
通常,你想要在硬盘上记录PAUP 分析的结果,这样使得你有你分析的结果的记录.
1 开始日志记录
Mac 和 Windows .选择File > Log Output to Disk...
Mac .在Log subsequent output to: 下输入practice.log ,单击
Start Saving
Windows . 在Filename: 下输入practice.log 单击Start
Portable . 输入:log start file=practice.log;
2 停止记录
在PAUP 决议的任何时候都可以开始和停止日志记录. 如果要停止日志记录,按以下操作:
Mac . 选择File > Log Output to Disk... 并单击Stop Saving
Windows . 选择File > Log Output to Disk...
Portable . 输入: log stop;
总结数据
现在这个数据矩阵正被分析,你可以获得这个数据设置的基本总结数据.一开始,你可以显示关
于这个例子数据设置元素的信息.
Mac . 选择Data > Show Character Status...
. 不要改变默认设置并单击OK.
Portable 和Windows . 输入: cstatus;
PAUP* 将显示关于当前元素状态的总结 (如类型,权重,等等). 注意,如果打开记录,显示在屏幕上的总结信息也会被保存在日志文件中.你也可以选择去显示分类 (tstatus)、全部数据矩阵( showmatrix )和更多的总结,所有的这些命令都在DATA(数据）菜单下面.
