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克隆心得:帮助新手快速做出克隆
作者:olivercyber 来源:丁香园 时间:2006-11-8

    要将PCR产物接入的质粒载体A,取A质粒3μL进行酶切。

    A质粒酶切-制作载体片断
    公用Buffer 3μL
    酶 I   1μL
    酶 II   1μL
    质粒   3μL
    双蒸水   22μL
    合计   30μL

    混匀

    37℃,酶切3小时。

    1%琼脂糖回收胶回收(碎胶、酚氯仿抽提法)

    1. 酶切产物加入10%量的上样Buffer,混匀。使用1%的琼脂糖回收胶,电泳回收酶切产物。
    2. 用手术刀切下所需要的大片断(载体)和小片断(插入片断),收入一个1.5mL离心管中。 (提示 切胶前,需用分别含酒精、NaOH和双蒸水的纸巾擦拭凝胶接触的台面,以防污染。 手术刀要火焰消毒,而后切胶回收。)
    3. 12000rpm 1分钟,将凝胶甩到管底。 -20℃ 冰冻20分钟。
    4. 取200μL Tip 头两只,在酒精灯上稍烤化Tip头尖端,两Tip头尖相对来回相接触,在Tip头顶部制成直径3mm左右的平头,准备用于碎胶。
    5. 从-20℃取出冻结的凝胶,立即使用200μL枪套上平头Tip头,捣碎凝胶。(提示 200μL的枪足够粗壮,不要用100μL的枪,小心折断!!! 乘凝胶比较硬时就开始碎胶,轻而频率高地捣碎凝胶)
    6. 凝胶管中加入500μL双蒸水,盖紧,振摇200下。
    7. 加入500μL Tris饱和纯酚,盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心15分钟。
    8. 在一新1.5mL 离心管中加入 500μL 氯仿:异戊醇(24:1),将步骤7的上清加入本步骤离心管中。盖紧,振摇200下。 12000rpm 4℃ 离心5分钟。
    9. 在一新1.5mL 离心管中加入 900μL 预冷 无水乙醇、20μL 3M的醋酸钠。将步骤8的上清小心加入本步骤离心管中。颠倒数次混匀。12000rpm 4℃ 离心15分钟。(提示 吸取步骤8中的上清时,千万不要将有机相吸入,宁可放弃一些上清,否则影响后面的连接反应。 另外,本方法使用的醋酸钠量较小,但足够沉淀核酸,并且无需洗盐。)
    10. 弃上清,将离心管导致于干净吸水纸巾上5分钟。室温下吹风干燥。(提示 可将试管至于超净台吹风干燥。 如果管底有较多液体聚集,可盖好管盖后,轻弹管底数次,将液体分散挂在管壁上,再打开管盖吹风)

    连接

    向回收DNA的试管中加入8μL 双蒸水,盖紧,弹击管底使液体尽量接触管壁。瞬时离心将液体甩到管底,再加入1μL ligase Buffer,1μL T4 ligase(连接酶)。弹击管壁混匀,瞬时离心将液体甩到管底。 置4℃过夜。 (提示 Ligase Buffer应该在首次融解后分装,每管可2-3μL,-20℃存储。 4℃过夜可获得最多的转化克隆。)

    三、 一步法感受态细胞制作(已经检验过DH5α和BL21系菌,采用此方法的转化效率足够高)

    来自Nucleic Acid Research 1988 16 3580
    Rapid and Convenient method for the preparation and storage of competent bacterial cells.
    Chung CT, Miller RH.

    下载链接:http://www.pubmedcentral.gov/pagerender.fcgi?artid=336520&pageindex=1

    (提示:建议首次使用本方法时,先培养20mL菌,可得到总数2mL的感受态菌,足够作30次转化。制作感受态细胞时注意无菌操作。)

    1. LB medium 培养至 OD值 0.3-0.5。
    2. 4℃ 3000g(或6000rpm) 5分钟。弃上清,收菌。
    3. 重悬于原培养体积1/10的TSB中。
    4. 冰上置10分钟。 分装,每管60μL,置冰上。放入-70℃冰箱。(提示 每次使用拿出一管,避免反复冻融。 -70℃可保存一年不影响转化效率)

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