SSCp法除大量地用于基因突变的检测外，还用于病毒的分型、监测pCR实验中的污染 情况、以及病原体传播途径的研究中.Yap用巢式pCR对来自不同国家和地区的HbV标品 进行了检测，并对扩增产物进行了SSCp分析，发现每个标本的SSCp图谱完全不同，不 仅证明了HbVDNA具有地区性变异，而且排除了交*性污染的可能性，为保证pCR诊断 结果的可靠性找到了好方法.另外，Yap等还将SSCp用于DNA定量分析上，他们将SSCp 与竞争性pCR法相结合进行乳腺癌细胞突变p53基因的定量分析，并取得了初步成功. 该方法的优点在于，内标和待测DNA只有一个碱基不同，这样使内标和待测DNA有相同 的扩增条件，从而更准确地测出DNA的量.从以上可以看出，SSCp正在分子生物学领域 发挥着巨大的作用.
五、SSCp注意的事项
SSCp是一种快速、简便、灵敏的检测基因突变的方法，为了使SSCp达到最佳效果，应 注意下列事项.
①重复性.影响SSCp重复性的主要因素为电泳的电压和温度.这两个条件保持不变， SSCp图谱可保持良好的重复性.一般SSCp图谱是二条单链DNA带，但有时有的DNA片段 可能只呈现一条SSDNA带，或者三条以上，这主要是由于两条单链DNA之间存在相似的 立体构象.有时三条以上的SSCp图谱是由于野型DNA片段和突变型DNA片段共同存在的 结果.
②靶DNA序列长度的影响在实验中发现SSCp对短链DNA或RNA的点突变检出率要比长链 的高，这可能是由于长链DNA和RNA分子中单个碱基的改变在维持立体构象中起的作用 较小的缘故.而有人认为在DNA链较短的(400bp以下)情况下，DNA的长度不会影响SSCp 的效果.他们仔细选择了实验条件，发现354bp的DNA中点突变的检出率仍可达到90%以 上.
③电泳电压和温度的影响:为了使单链DNA保持一定的稳定立体构象，SSCp应在较低温 度下进行(一般4℃-15℃之间).在电泳过程中除环境温度外，电压过高也是引起温度 升高的主要原因，因此，在没有冷却装置的电泳槽上进行SSCp时，开始的5min应用较 高的电压(250V)，以后用100V左右电压进行电泳.这主要是由于开始的高电压可以使 不同立体构象的单链DNA初步分离，而凝胶的温度不会升高.随后的低电压电泳可以使 之进一步分离.在实验中应根据具体实验条件确定电泳电压.
④DNA片段中点突变的位置对SSCp的影响点突变在DNA和RNA中的位置对SSCp检测率的 影响，取决于该位置对维持立体构象作用的大小，而不是仅仅取决于点突变在DNA链 上的位置(有人认为点突变在DNA链中部要比在近端部容易被SSCp检测出来).White曾 设计了一组样品DNA片段，并将其中的点突变设在DNA链的中部，而且该点又正处在发 夹结构顶端的环上，结果发现SSCp只能检测出9个样品中的2个(检出率为22%)，说明 DNA链中任何部位的突变，只要对其单链立体构象没有影响，都有可能被漏检.
⑤SSCp的结果断定:由于在SSCp分析中非变性pAG电泳不是根据单链DNA分子和带电量 的大小来分离的，而是以单链DNA片段空间构象的立体位阻大小来实现分离的，因 此，这种分离不能反映出分子量的大小.有时正常链与突变链的迁移率很接近，很难 看出两者之间的差别.因此一般要求电泳长度在16--18cm以上，以检测限为指标来判 定结果.检测限是指突变DNA片段与正常DNA片段可分辨的电泳距离差的最小值.大于检 测限则判定链的迁移率有改变，说明该DNA序列有变化，小于检测限则说明链之间无 变化.例如，一般检测限定为3mm，那么当两带间距离在3mm以上，则说明两链之间有 改变.另外检测限不能定的太低，否则主观因素太大，易造成假阳性结果.另外，SSCp 分析中其它条件，如pCR产物的上样量，pAG的交联度、以及胶的浓度等，都应根据具 体实验进行选择确定.总之，SSCp分析法是一种快速、简便、灵敏的突变检测方法， 适合临床实验室的要求.它可以检测各种点突变，短核苷酸序列的缺失或插入.随着 SSCp分析不断完善，它将成为基因诊断研究的一个有力工具.
