(4)Primer 5’未端可修饰、突变:
修饰
如:32P、生物素、荧光素,不影响其效果
突变:
AGCTCCATGACCCAG
5’CGCTCCATGACCCAG 3’
注意:绝不可以在3’端进行上述改造
∵DNA聚合酶是5’→3’聚合,若3’端改造→不能互补→不能延伸
(5)primer 5’端增加碱基

②ATG起始密码
③TAA、TAG、TGA终止密码
如: 可溶性受体的表达,无膜内区、穿膜区,只有膜外区。
3.模板:
可选:DNA
mRNA→逆转录→cDNA
DNA包括: 质粒 噬菌体 染色体DNA
较小 较大 ①目的gene是单拷贝
变性较易 变性较难 ②非常大,变性难
模板用量
Plasmid:lng
Chromosome:300-500ng
注意: 防止交叉污染
4.dNTP:
四种脱氧核苷酸,基本原料
终浓度:50mM
注意:不稳定,保5.Mg2+
TaqDNA聚合酶作用时需要Mg2+
不同的酶需不同Mg2+
Taq:较少,Mg2+对反应影响很大,0.5-1.5mM终浓度
pfu:Mg2+ 2-3mM,dNTP、primer用量约增加一倍
外界影响: EDTA鳌合Mg2+ ∴选较低浓度TE(10mM Tris,1mMEDTA); DNA模板、引物和dNTP 的磷酸基团均可与Mg2+结合, 降低Mg2+有效浓度。 ∴如果扩增产物或效率不理想,要注意调整合适的 Mg2+浓度 存时间长会失效
6.温度和时间:
(1)变性温度:94-95℃
Templete:GC比例高、长度很长,则变性T↑
(2)退火:温度越高,扩增特异性越好
取决于Tm值:Tm↑退火T↑;
Tm↓退火T↓
若Tm较高,可使退火和延伸在同一温度
(3)延伸:
£500nt---1min >500nt--3min
一般:40-60sec
(三)PCR技术的应用
1. 基因检测:
2. 基因克隆化
3. DNA突变
4. DNA序列分析

