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Rt-PCR实验步骤
作者:未知 来源:生物秀 时间:2006-9-27

    注:
    1、RNA若用于核酸转移应溶解于样本缓冲液中,否则DEPC溶解
    2、细胞组织加TRIzol匀浆后,可在-60℃放置至少一个月(甚至可一年以上)
    3、RNA在75%乙醇中,2-8℃至少可保存一周,-20℃至少可保存一年

    两步法RT-PCR
    (第一步:逆转录反应)
    试剂 浓度 体积 终浓度
    RNA 23μl(11.5μl)
    Oligo(dT)15 0.05μg/μl 4μl(2μl) 0.005μg/μl
    (稀释10倍后用)

    混匀,离心,70℃ 5min

    立即冰水浴,稍离心

    试剂 浓度 体积 终浓度
    M-MLV Buffer 5× 8μl (4μl) 1×
    dNTP 10mM 2μl (1μl) 0.5mM
    RNasin 40U/μl 1μl (0.5μl) 20μ
    M-MLV 200U/μl 2μl (1μl) 200U
    总体积40μl(20μl)

    混匀,离心,42℃ 60min

    95℃ 10min(破坏MLV)

    4℃保存
    两步法RT-PCR
    (第二步:PCR反应)
    总体积20μl(50μl)
    试剂 浓度 体积 终浓度
    Taq Buffer 10× 2μl (5μl_) 1×
    MgCl2 25mM 1.2μl (3μl) 1.5mM
    dNTP 10mM 0.2μl (0.5μl) <200uM
    上游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol
    下游引物 10pmol/μl 0.3μl (1μl) 10pmol
    cDNA模板 X (?) (1-10μl)
    DEPC水 20μl-4.3μl-X
    Taq酶 2.5U/μl 0.3μl (1μl) 2.5U/μl

    混匀

    97℃,5分钟

    立即冰水浴

    混匀

    95℃ 5分 预变性
    94℃ 30秒 变性
    X℃ 40秒 退火
    72℃ 30秒 延伸
    72℃ 7分 终末延伸
    28-36循环,4℃保温
    三、电泳:
    加1-10μl PCR产物+溴芬兰(1-2.5μl)混匀,加样,电泳。
    注意:Taq酶、M-MLV、Rnasin等-20℃保存,操作时置于冰上。DNTP勿反复冻融。

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