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Rt-PCR实验步骤
作者:未知 来源:生物秀 时间:2006-9-27

    六、需购置的Rt-PCR材料:
    (生工. Tel. 2236106.)
    Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00
    dNTP: 1支
    oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega
    M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)
    RNasin: 1支 110
    -- -20℃
    DEPC 5g 110.00
    Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies
    -- 4℃
    Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00 科威
    (1543. 994. 697. 515. 377. 231)
    七、引物合成

    正义:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′
    反义:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′
    2、par-4:
    正义:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′
    反义:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′
    3、退火温度计算
    2(A+T)+4(G+C)
    正反义平均数,再上下波动度(±4℃,或±5℃)
    4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分装好
    5、引物稀释:
    加DEPC水量为(μl)
    = ? nmol / OD × 管上所标OD数×100
    是为10p mol / μl 浓度的引物溶液
    八、PCR产物电泳
    先将1-10μl左右PCR产物,加已点在纸上的溴酸兰,反复吸打混匀后进行电泳,一般电流为10mA,电源100V,电泳30分钟,紫外灯下观察,满意的结果扫描打印。
    九、几个注意点:
    1、逆转录的关键步骤是立即冰水浴?
    2、Rt时,先打开PCR预热30分钟。
    3、RNA抽提前,打开离心机预冷。
    TRIzol法抽提总RNA
    细胞1×107
    组织100mg

    加1mlTRIzol
    细胞用1ml加样器吹至液体澄清且无细胞团块

    匀浆(要彻底,后转至EP管)
    (组织匀浆量>100mg时分装1ml/每EP管)

    颠倒混匀10下,室温5分钟

    加氯仿1/5体积(0.2ml)(必须按总体积的1/5)

    颠倒混匀10下,室温5分钟

    4℃,离心12000g,15分钟

    转上层水相(约400μl)于另一1.5mlEP管中

    加等体积异丙醇(约400μl),混匀室温10分钟

    4℃,离心12000g,10分钟

    弃上清

    加冰预冷的75%乙醇(用DEPC水配)1ml

    4℃离心7500g,5分钟

    弃上清,空气干燥5-10分钟(不能完全干燥)

    溶于DEPC水中至20μl(10μl-20μl)
    (可在55-60℃水中,<10分钟助溶)

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