Funkhouser等将在AGMK细胞上培养生长的HAV-175株，转种到MRC-5细胞上培养，然后进行核苷酸序列比较分析，发现该转种株(适应株)有13个核苷酸发生变异.其中有4个在5'非编码区，9个在编码区，Cohen等对HAV野毒株HM-175和减株HM-175/7MK5的cDNA核苷酸序列进行比较，发现有24个核苷酸发生变异，并导致12个氨基酸发生了变异.其中5'非编码区有7个核苷酸发生变异.
P1、P2和P3区分别有3、8和5个核苷酸发生变异;3'端非编码区有一个核苷酸变异，因而认为HAV的减毒是由于其基因组中相对小量的核苷酸改变所致.生物学变异主要是在核苷酸变异的基础上，发生了对细胞的亲和性的改变及HAV毒力性的改变.
(四)引物的设计
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序号 |
引物序列 |
位置 |
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扩增片段(bp) |
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1. |
FA，5'-GGAAATGTCTCAGGTACTTTCTTTG |
2390～2414 |
互补链 |
248bp |
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FB，5'-GTTTTGCTCCTCTTTATCATGCTATG |
2167～2192 |
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2. |
FA，5'-GGCCCACTGGAGTAAACCAGGCCA |
2674～2697) |
互补链 |
531bp |
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FB，5'-GTTTTGCTCCTCTTTATCATGCTATG |
2167～2192 |
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3. |
F1，5'-CAACTGCAGCCAGTGCTCCAGACACGGC |
2838～2865) |
互补链 |
715bp |
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F2，5'-AGGAATTCACTTGAATGTTTTGCTCCTCTT |
2150～2179) |
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4. |
P∶5'-TCCCAGAGCTCCATTGAA-3' |
2976～2993) |
互补链 |
300bp |
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N∶5'-CATTATTTCATGCTCCTCAG-3' |
3257～2376 |
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二、病原学检测现状
1.HAV及HAAg的检测:在潜伏期未与发病早期可用免疫电镜检出HAV，亦可用RIA和ELISA检测血、尿、粪中的HAAg，此期也可采取上述标本对HAV进行培养鉴定.
2.检测抗HAV、抗-HAVIgM和抗HAVIgA:急性期可用ELISA或RIA检测血清中抗-HAVIgM，它是确诊甲型肝炎的特异性血清学指标.其次抗-HAVIgA对于甲肝的早期诊断亦有意义.
3.HAVRNA:甲肝潜伏期与急性期早期，在血、尿、粪中用PCR技术或分子杂交检测到HAVRNA，即可确诊.
三、PCR应用评价
由于在急性期与潜伏期未在血、尿、粪中均有HCV存在，用PCR技术扩增检测HCVRNA，非常适用于甲肝的早期诊断.它不仅可用于现症病人的早期诊断，还能用于亚临床感染者、隐性感者的检测及环境污染HAV的监测.是进行流行病研究的重要手段.
但HCV是RNA病毒，做PCR时先要将RNA反转录成cDNA后才能做PCR，而且一般要做巢式或双PCR才能得出好的结果.其技术要求精度较高，程序较为繁复，但其特异性与敏感度是其它技术不可比拟的.
四、进一步深入研究的课题方向
(一)用PCR进行分型研究
建立HAVPCR分型方法，使HAV的流行病学研究进入分子水平，用其来分析HAV的流行因素，流行特征及地理分布，确定暴发与传染源之间的联系，对甲型炎肝的防治具有重要意义. (二)毒力的分子生物学研究 研究HAV毒力的分子学基础，有助于分析研究野毒株与减毒株之间核苷酸的变异性情况，确认疫苗毒力减弱的基因标志，可用于制备基因工程疫苗、监视疫苗可能出现的回复突变. 乙型肝炎病毒
乙型肝炎是一种世界性传染病，我国是高流行区，我国有50%～70%的人群受过乙型肝炎病毒的感染，有8%～10%为乙型肝炎表面抗原携带者，约有一亿人口，根据1980年全国调查表明，我国现在患肝炎的病人约2000万人，其中60%以上为慢性肝炎患者.乙型肝炎病毒又与肝硬变以及原发性肝细胞肝癌密切相关，我国同时也是肝癌的高发国家;如何预防、如何治疗、急待解决.解决这一问题的关键之一在于准确无误的诊断，要达到准确无误的诊断，就需要深入细致的研究乙型肝炎病毒的分子生物学特点，尽可能地采用现代分子生物技术加以研究和检测.
