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骨、牙组织模板DNA提取——Glass milk改良法
作者:未知 来源:西安交通大学 时间:2006-9-19
    1 主要配制试剂
    1)0.5M Na2EDTA PH8.0
    2) Proeinase K(20 μg/ul)
    3)6M GuSCN 10ml
    GuSCN 7.2g
    加D·W至10ml
    水浴60℃~65℃溶解
    4) 二氧化硅悬浮液(Silica susponsion、用前混匀)
    Silica 12g加D、W至100l

    充分混匀置于100ml量筒内室温沉降24小时

    取上层溶液85ml加D、W至100ml,置于100ml量筒内充分混匀室沉降5小时

    取上层溶液85ml加12μl 10M HCL、充分混匀
    分装、高压灭菌(121℃ 20min)备用。
    5) 70%乙醇(-20℃)
    6)丙酮(-20℃)
    7)Nuclease free H2O
    2 主要仪器
    旋转混摇器(rotator)
    电泳仪
    紫外分析仪
    调速摇床(Rocker Platform)
    Shimadzu UV-250型紫外分光光度计
    3 操作步骤
    3.1 样本准备
    1)骨:骨高压灭菌细沙纸磨去骨表面0.5mm厚层,254nm紫外线照射1小时以防外源性DNA污染;然后用冷的去离子水、乙醇、乙醚各振摇15分钟,取出干燥。将骨片放入盛有液氮搪瓷碗内用小型手电钻钻取骨粉备用。
    2)牙:254nm紫外线照射1小时,然后用冷的去离子水、乙醇、乙醚各振摇15分钟,干燥后在液氮中冷冻24小时。用高压灭菌的密度白布包裹,榔头敲击成细粉沫备用。
    3.2 骨、牙组织DNA分离和纯化
    1)流程图
    样本+DNA提取buffer消化

    二氧化硅结合DNA

    70%乙醇、丙酮洗涤硅珠

    56℃洗提DNA

    去除二氧化硅

    转移DNA溶液

    -20℃保存备用
    2)操作
    ①取骨粉0.25g(牙粉沫0.1g)置于1.5Eppendorf管,加1.0ml 0.5M Na2EDTA(PH8.0),25μl proteinase K(20μg/μl)。将Eppendorf管置于旋转混摇器上,室温混摇24小时。
    ②将样品Eppendorf管置于56℃干热器上继续消化2小时。
    ③离心13000rpm,5分钟。
    ④取上清液700μl移至另一洁净1.5ml Eppendorf管中(弃沉渣),加700μl 6M GuSCN,20⑤μl二氧化硅悬浮液置于旋转混摇器上,室温混摇2小时。
    ⑤离心13000rpm,20秒,充上清液保留硅珠。
    ⑥用-20℃ 70%乙醇洗涤硅珠两次,每次离心13000rpm,20秒。
    ⑦用-20℃丙酮洗涤一次,离心13000rpm,20秒。
    ⑧样品Eppendorpf管置于56℃干热器上,15分钟洗提DNA,每5分钟振摇一次。
    ⑨离心13000rpm 2分钟,将60μl DNA溶液移至0.5ml Eppendorf中,置于-20℃保存备用。
    3.3 DNA定量
    3.3.1 凝胶定量
        1)配制1%琼脂糖凝胶:将2g琼脂糖加入200ml 1×TBE缓冲液中,煮沸溶化,待冷却至60℃加入10μlEB,充分混匀。
        2)将琼脂糖溶化液灌入制胶模具,放置30分钟,使其冷却固化。
    3)小心取出加样硫,将已制好凝胶放入电永槽,加1×TBE缓冲液使其高出胶面约1cm。
    4)将标准含量(30μg/ml、20ng/ml、10ng/ml、50μg/ml)DNA样品,标准DNA分子量Marker和可见性DNA参照置于干热器孵育5分钟,稍离心。
    5)将可见性DNA参照物及用作下量尺度的标准量DNA各10μl及待测DNA样品按从左向右依次加入胶中,两侧加标准DNA分子量Marker。
    6)150v电压电泳30分钟。
    7)紫外分析仪上观察结果并照像,与标准品对照推算样本DNA含量。
    3.3.2 紫外分光光度计法
    采用Shimadzu UV-250型紫外可见分光光度计测定DNA浓度,仪器预热10分钟,用1.0ml去离子水校正零点,吸取10μl DNA样品加990μl去离子水混匀,转入石英比色杯中。在260nm,280nm和320nm处读出光密度。依据公式DNA样品浓度=A260×核酸稀释倍数×50‰;提取DNA溶液中蛋白含量=1.55×(A280-A320)-0.76×(A260-A320)进行计算,核酸纯度由A260/A280的比率进行估计。
    4 注意事项
    1.本技术标准运用于自然条件下保存6~60年骨。
    2.不同处理保存状况对骨组织DNA稳定性影响不同(如加碱水煮,火烧等),骨组织DNA骨减少。
    3.本技术采用高压灭菌细砂纸磨去骨表面0.5mm厚层,254nm紫外线照射1小时消除外源性DNA污染。
     
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