毛细管电泳技术也称为高效毛细管电泳(high performance capillary electrophoresis，HPCE)。是从传统电泳发展而来的新型高效的分析分离技术。1967年Hjerten最先提出区带电泳。1974年Virtanen提出用200—500µm内径的毛细管作电泳分离。 1981年Jorgenson和Lukace首先提出在细管径毛细管内进行电泳。
1 原理
毛细管电泳的基本原理是：缓冲液中不同带电离子在高压（10—30KV）电场作用下，以石英毛细管为分离痛道，被分离物以不同的速度迁移而达到分离的目的。
2 实验流程
制备样品→选择适当的试验程序→清洗毛细管→更换电泳缓冲液进行电泳→同时在线检测
3 特点
优点：分离操作时间短，最快可达几秒；分离效率高；样品用量少，容剂消耗少，环境污染小；操作自动化程度高，可用计算机控制实现软件分析。缺点：制备能力差；由于毛细管电泳采用内径极小，而只能进行微量分析；不能对多个样品进行平行处理，而只能对单个样品进行多次进样分析，缺乏平行对照，这要求很高的重复性。
4 应用
毛细管电泳技术可应用于：无机及有机化合物的分离分析；蛋白质、氨基酸、肽的分离分析；核酸的分离分析；对映体的分离分析；CE在药物及临床分析中的应用。目前,毛细管电泳应用于作物贮藏蛋白研究中具独特优势，特别是在品种及种质指纹图谱构建，优质蛋白质亚基的快速鉴定、筛选与品质改良，以及目的基因的分离、克隆与鉴定等方面具有广泛的应用前景。
