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生物信息学软件及使用概述
作者:刘吉平 来源:liujiping@scau.edu.cn 时间:2006-9-17

    生物信息学的概念:
    生物信息学是一门新兴的交叉学科,它将数学和计算机知识应用于生物学,以获取、加工、存储、分类、检索与分析生物大分子的信息,从而理解这些信息的生物学意义。

    生物信息学软件主要功能
    1.分析和处理实验数据和公共数据,加快研究进度,缩短科研时间 
    Ø核酸:序列同源性比较,分子进化树构建,结构信息分析,包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框(ORF),蛋白编码区(CDS)及外显子预测、RNA二级结构预测、DNA片段的拼接;
    Ø蛋白:序列同源性比较,结构信息分析(包括Motif,限制酶切点,内部重复序列的查找,氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析),等电点及二级结构预测等等;
    Ø本地序列与公共序列的联接,成果扩大。
    Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图:

    Peptool Lite--- Dot Plot 点阵图


    DNASIS 2.5 RNA 二级结构预测

    DNASIS 2.5 tRNA 二级结构预测

    RNAStructure 3.5 RNA 二结构预测

    Omiga 2.0 ORF Map

    DNAStar 之 Protean 对氨基酸的亲疏水性 分析:helical wheel 图


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