26)我想在想纯化peg修饰的蛋白，可是我目前只有弱阳离子交换的羧甲基纤维素，你看能不能纯化阿，好像文献上都用sp-sepharose，纤维素是不是不行啊？另外，目前没有专门的层析装置和蠕动泵，我用普通的层析柱是不是就可以阿，流量是不是也不用太精确阿？谢谢！
离子交换的方法是可以的，但是我觉得疏水也很值得一做，因为修饰后电荷变化了，其实疏水性也增加了，所以这些方法都可以，此外只要你的CM纤维素能挂住就可以分离，，SP-sepharose只是更强点，而且流速更好点，你先试试，不行再换吧。没有蠕动泵纤维素流速会比较慢吧，流量肯定不精确，我觉得还是有个泵好点，没有检测器也不行，这些是纯化的基础，要不可是比较麻烦的，怕实验难重复。何况你没有泵也没有办法做线性剃度洗脱。反正是太简单点。
27)问一个有关DEAE Sephadex A 50的问题，我的填料处理好后别人拿去用了，用了一次，结果我把他放到烧杯后，发觉已成絮状，不知有没有坏掉？可以再用吗？用什么方法可以把它恢复到原状？
这个絮状的东西有颜色吗，会不会是染菌了，或者是脏的东西没有处理干净，你可以用0.5MNaoH泡半小时，沉淀后倾去上清，做三次这样的处理，如果还有不干净的东西，你可以用6M盐酸胍泡半个小时，然后处理和NaoH一样，再换水，这样你看能不能洗回来，如果不能很好沉淀下来，那就不能用了。凝胶类的填料很容易长菌，用完得洗干净，保存在20%的乙醇中。
28)首先我想问一下agarose和sepharose区别,我的理解是:都指琼脂糖,但agarose是未连接其他介质的,而sepharose是连接其他介质的,不知理解对不对?请指教!Glutathione-agarose(4%cross-linked beaded agarose)和Glutathione Sepharose 4B是一种东西吗?
其次,我想问一下你纯化过GST融合蛋白没有?我现纯化一个融合蛋白(某种酶和GST融合),我买了SIGMA公司的GLUTATHIONE-AGAROSE五毫升,但我不知怎么做.分子克隆说直接将亲和介质于细菌裂解液混允离心....我不知我买的可不可以这样做.而产品说明书上说做柱子,我就想1毫升的柱子怎么做,装介质的柱子的高度和直径有要求吗?
agarose是通常的琼脂糖的英文名称，大家都这么叫，它不是商品的注册名称。而sepharose是amersham的琼脂糖凝胶的注册商品名称。所以你理解是有偏差的，此外agarose不一定是琼脂糖凝胶，而Glutathione-agarose(4%cross-linked beaded agarose)和Glutathione Sepharose 4B是同一类东西，只是厂家不同。
GST融合蛋白纯化过，5ml的凝胶你可以装在1.6x20的柱子上用，也可以按照分子克隆的做法做，取决于你的喜好和方便。1ml不好装，除非有专门的小柱子，对于直径和高度没有特别的要求，我们的做法是：
1、 GST琼脂糖凝胶FF装柱，0.7X2.5cm，柱床体积为1ml；
2、 用缓冲液1平衡5个床体积，流速为1ml/min；
3、 将10ml发酵液用缓冲液1稀释到20ml，0.45μm滤膜过滤，上样。流速为1ml/min；
4、 用缓冲液1再洗10个床体积，流速为1ml/min；
5、 用缓冲液2洗脱，流速为1ml/min，收集洗脱峰
6、 用纯水洗5个柱床体积，再用20%的乙醇洗5个柱床体积，流速为1ml/min，柱子置于+4~8℃环境中保存
缓冲液组成：
缓冲液1：20 mM磷酸盐缓冲液，pH7.4，即pH7.4的PBS溶液。配制：0.2 M NaH2PO4 19ml，0.2 M Na2HPO4 81ml加水至1000ml。
缓冲液2：50mM Tris-盐酸缓冲液，pH8.0，配制：0.1M Tris 50ml，0.1 M 盐酸29.2ml，307mg还原型谷胱甘肽，加水至1000ml。
29)请问con A sepharose 4B 亲和凝胶使用前的处理方法？
不需要特别处理，直接平衡后就可以上样了。
30)谢谢，我想问一下，是不是离子交换必须要线形梯度洗脱比较好呢？还是阶段洗脱好？检测器我想先收集然后再去测紫外。
也不是,有的时候阶段洗脱效果就很好,而且容易放大,不需要仪器,我比较喜欢,效果差不多,但是很省事.但是关键是容易重复.紫外分管测定那也可以,我上学也那样做过.
31)我要从总蛋白中提出250KD的NF1蛋白做western，由于量少所以要做免疫沉淀。我是利用小鼠来源的NF1单抗与兔抗小鼠IgG、protein A－sepharose来做免疫沉淀，发现做完后跑电泳，出现了两条带，分别位于85KD、55KD左右，请问这会是什么东西？会是抗体吗？还有没有可能是目标蛋白变小了？
抱歉,我没有做过免疫沉淀,但是抗体做过一些,抗体重链没有大到85KD的地步,所以应该不是抗体.会不会你的蛋白有四个部分构成,分别是两个85KD和55KD,这样分子量正好和你的250KD相当,你可以跑非还原电泳看看,是不是还这样呢.如果不是,那说明是由这两个部分组成的.都是由二硫键连接的.
32)我提胰蛋白酶，主要参考用张龙翔书里的办法，先提卵类粘蛋白，首先过SEPHADEX G-25 柱子脱盐，然后过DEAE纤维素离子交换柱；第二步是用卵类粘蛋白合成SEPHAROSE-4B亲和柱。这些层析过程都可以在缓冲液里面加0.02%的叠氮化钠抑菌吗？以后怎样去除？
我提胰蛋白酶粗酶用的乙醇，可以用异丙醇或正丁醇或其它的低分子醇吗？浓度多大为好？
那实验我知道，你用什么方法活化琼脂糖呢，胰蛋酶的亲和纯化方法很多，配基有大豆胰蛋白酶抑制剂，抑肽酶，苯甲脒类，特别是后面的苯甲脒，可以买到现成的苯甲脒琼脂糖凝胶，何必自己去提取呢，感觉比较复杂，自己偶联这些配基也可以，层析过程不需要加0.02%的叠氮化钠抑菌，尽量不要加，那透析或者除盐柱子都可以，或者直接上一样的亲和柱子，用不含这个的缓冲液洗，最后洗脱下来就可以了。
最好还是用乙醇，浓度很难说，因为和你的蛋白浓度有关，别的醇用得很少。此外你可以考虑用硫酸铵沉淀，这样对活性更好些。纯化也可以用疏水，因为它在苯基琼脂糖凝胶柱子上能被吸附，配合硫酸铵沉淀也是不错的选择。
